Breakthrough Prospective Μελέτη: Η τεχνολογία μεθυλίωσης CTDNA που βασίζεται σε PCR ανοίγει μια νέα εποχή παρακολούθησης MRD για καρκίνο του παχέος εντέρου

Πρόσφατα, η Jama Oncology (IF 33.012) δημοσίευσε ένα σημαντικό ερευνητικό αποτέλεσμα [1] από την ομάδα του Prof. Cai Guo-Ring από το Νοσοκομείο του Πανεπιστημίου Fudan και τον καθηγητή Wang Jing από το νοσοκομείο Renji του Shanghai Jiao Tong School of Medicine, σε συνεργασία με την Kunyuan Biology: " Μεθυλίωση και διαστρωμάτωση κινδύνου) ". Αυτή η μελέτη είναι η πρώτη πολυκεντρική μελέτη στον κόσμο για την εφαρμογή της τεχνολογίας μεθυλίωσης CTDNA που βασίζεται σε PCR για την πρόβλεψη και την παρακολούθηση της υποτροπής και την παρακολούθηση της υποτροπής και της παρακολούθησης της υποτροπής και της παρακολούθησης της επανάληψης του καρκίνου και της λύσης σε σύγκριση με τις υπάρχουσες μεθόδους τεχνολογίας ανίχνευσης MRD, η οποία αναμένεται να βελτιώσει σε μεγάλο βαθμό την κλινική χρήση της υποτροπής του καρκίνου του χρωστικού καρκίνου και της παρακολούθησης της υποτροπής του καρκίνου του χρωστικού. Η μελέτη αξιολογήθηκε επίσης από το περιοδικό και τους συντάκτες της και αναφέρθηκε ως βασικό έγγραφο σύστασης σε αυτό το τεύχος και ο καθηγητής Juan Ruiz-Bañobre από την Ισπανία και τον καθηγητή Ajay Goel από τις Ηνωμένες Πολιτείες κλήθηκαν να το αναθεωρήσουν. Η μελέτη αναφέρθηκε επίσης από την GenomeWeb, τα κορυφαία βιοϊατρικά μέσα στις Ηνωμένες Πολιτείες.

Ο καρκίνος του παχέος εντέρου (CRC) είναι ένας κοινός κακοήθης όγκος της γαστρεντερικής οδού στην Κίνα. 2020 Διεθνής Οργανισμός Έρευνας για τον Καρκίνου (IARC) Δείχνουν ότι 555.000 νέες περιπτώσεις στην Κίνα αντιπροσωπεύουν περίπου το 1/3 του κόσμου, με το ποσοστό επίπτωσης να πηδάει στη δεύτερη θέση των κοινών καρκίνων στην Κίνα. 286.000 θάνατοι αντιπροσωπεύουν περίπου το 1/3 του κόσμου, κατατάσσοντας ως την πέμπτη συνηθέστερη αιτία θανάτων από καρκίνο στην Κίνα. Η πέμπτη αιτία θανάτου στην Κίνα. Αξίζει να σημειωθεί ότι μεταξύ των διαγνωσμένων ασθενών, τα στάδια TNM I, II, III και IV είναι 18,6%, 42,5%, 30,7% και 8,2% αντίστοιχα. Περισσότερο από το 80% των ασθενών βρίσκονται στα μεσαία και καθυστερημένα στάδια και το 44% από αυτούς έχουν ταυτόχρονες ή ετεροχρονικές απομακρυσμένες μεταστάσεις στο ήπαρ και τον πνεύμονα, γεγονός που επηρεάζει σοβαρά την περίοδο επιβίωσης, θέτει σε κίνδυνο την υγεία των κατοίκων μας και προκαλεί βαρύ κοινωνικό και οικονομικό βάρος. Σύμφωνα με τα στατιστικά στοιχεία του Εθνικού Κέντρου Καρκίνου, η μέση ετήσια αύξηση του κόστους της θεραπείας του καρκίνου του παχέος εντέρου στην Κίνα είναι περίπου 6,9% έως 9,2% και οι προσωπικές δαπάνες για την υγεία των ασθενών εντός ενός έτους από τη διάγνωση μπορούν να καταλήξουν στο 60% του οικογενειακού εισοδήματος. Οι ασθενείς με καρκίνο πάσχουν από την ασθένεια και επίσης υπό μεγάλη οικονομική πίεση [2].
Ενενήντα τοις εκατό των αλλοιώσεων του παχέος εντέρου μπορεί να απομακρυνθεί χειρουργικά και όσο νωρίτερα ανιχνεύεται ο όγκος, τόσο υψηλότερο είναι το πενταετές ποσοστό επιβίωσης μετά από ριζική χειρουργική εκτομή, αλλά το συνολικό ποσοστό επανεμφάνισης μετά από ριζική εκτομή εξακολουθεί να είναι περίπου 30%. Τα πενταετή ποσοστά επιβίωσης του καρκίνου του παχέος εντέρου στον κινεζικό πληθυσμό είναι 90,1%, 72,6%, 53,8% και 10,4% για τα στάδια Ι, II, III και IV, αντίστοιχα.
Η ελάχιστη υπολειμματική ασθένεια (MRD) αποτελεί σημαντική αιτία υποτροπής όγκου μετά από ριζική θεραπεία. Τα τελευταία χρόνια, η τεχνολογία ανίχνευσης MRD για συμπαγείς όγκους έχει προχωρήσει γρήγορα και αρκετές βαρέων βαρών παρατηρητικές και επεμβατικές μελέτες επιβεβαίωσαν ότι η μετεγχειρητική κατάσταση MRD μπορεί να υποδηλώνει τον κίνδυνο μετεγχειρητικής επανάληψης του καρκίνου του παχέος εντέρου. Η δοκιμή ctDNA έχει τα πλεονεκτήματα της μη επεμβατικής, απλής, ταχείας, με υψηλή προσβασιμότητα δείγματος και την υπέρβαση της ετερογένειας του όγκου.
Οι κατευθυντήριες γραμμές των ΗΠΑ NCCN για τον καρκίνο του παχέος εντέρου και τις κατευθυντήριες γραμμές της κινεζικής CSCO για τον καρκίνο του παχέος εντέρου δηλώνουν ότι για τον προσδιορισμό του κινδύνου υποτροπής και την ανοσοενισχυτική χημειοθεραπεία στον καρκίνο του παχέος εντέρου, οι δοκιμές ctDNA μπορούν να παρέχουν προγνωστικές και προγνωστικές πληροφορίες για να βοηθήσουν τις αποφάσεις της ανοσοενισχυτικής θεραπείας για ασθενείς με καρκίνο του σταδίου II ή III. Ωστόσο, οι περισσότερες υπάρχουσες μελέτες επικεντρώνονται στις μεταλλάξεις ctDNA που βασίζονται στην τεχνολογία αλληλουχίας υψηλής απόδοσης (NGS), η οποία έχει πολύπλοκη διαδικασία, μακρά χρόνο παράδοσης και υψηλό κόστος [3], με ελαφριά έλλειψη γενικευσιμότητας και χαμηλού επιπολασμού μεταξύ των καρκινοπαθείς.
Στην περίπτωση των ασθενών με καρκίνο του παχέος εντέρου σταδίου ΙΙΙ, οι ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου, με βάση το NGS, το CTDNA δυναμικό κόστος παρακολούθησης έως και 10.000 δολαρίων για μία μόνο επίσκεψη και απαιτεί μια περίοδο αναμονής έως και δύο εβδομάδων. Με τη δοκιμή μεθυλίωσης πολυπόνης σε αυτή τη μελέτη, το Coloraiq®, οι ασθενείς μπορούν να έχουν δυναμική παρακολούθηση ctDNA σε ένα δέκατο του κόστους και να λάβουν μια αναφορά σε μόλις δύο ημέρες.
Σύμφωνα με τις 560.000 νέες περιπτώσεις καρκίνου του παχέος εντέρου στην Κίνα κάθε χρόνο, οι κλινικοί ασθενείς κυρίως με τον καρκίνο του παχέος εντέρου του σταδίου II-III (το ποσοστό είναι περίπου 70%) έχουν μεγαλύτερη επείγουσα ζήτηση για δυναμική παρακολούθηση, τότε το μέγεθος της δυναμικής παρακολούθησης του MRD του καρκίνου του παχέος εντέρου φτάνει τα εκατομμύρια των ατόμων κάθε έτος.
Μπορεί να φανεί ότι τα αποτελέσματα της έρευνας έχουν σημαντική επιστημονική και πρακτική σημασία. Μέσω μελλοντικών κλινικών μελετών μεγάλης κλίμακας, επιβεβαίωσε ότι η τεχνολογία μεθυλίωσης Multigene με βάση το αίμα CTDNA που βασίζεται σε PCR μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την πρόβλεψη της υποτροπής του καρκίνου του παχέος εντέρου και την παρακολούθηση της υποτροπής τόσο με ευαισθησία, επικαιρότητα όσο και με την αποτελεσματικότητα του κόστους, την καλύτερη δυνατή παρακολούθηση της ιατρικής ακρίβειας για να ωφεληθεί περισσότερους ασθενείς με καρκίνο. Η μελέτη βασίζεται στο Colonaiq®, μια δοκιμή μεθυλίωσης πολλαπλών γονιδίων για τον καρκίνο του παχέος εντέρου που αναπτύχθηκε από τον Kuny, του οποίου η κλινική αξία εφαρμογής στην πρόωρη εξέταση και διάγνωση έχει επιβεβαιωθεί από μια κεντρική κλινική μελέτη.
Το Gastroenterology (IF33.88), το Top International Journal στον τομέα των γαστρεντερικών παθήσεων το 2021, ανέφεραν τα πολυκεντρικά ερευνητικά αποτελέσματα του νοσοκομείου Zhongshan του Πανεπιστημίου Fudan, του Confernative Cornel και των άλλων αυθεντικών ιατρικών ινστιτούτων σε συνδυασμό με το Kunyan Biological, που επιβεβαίωσε την εξαιρετική απόδοση του Colonaq® Changaiq® στην Early Screensing and Diagnals of Colorectal, Εξετάζει επίσης την πιθανή εφαρμογή στην παρακολούθηση της πρόγνωσης του καρκίνου του παχέος εντέρου.

Για την περαιτέρω επικύρωση της κλινικής εφαρμογής της μεθυλίωσης ctDNA σε διαστρωμάτωση κινδύνου, καθοδηγώντας τις αποφάσεις θεραπείας και την παρακολούθηση της πρώιμης υποτροπής στο στάδιο I-III του καρκίνου του παχέος εντέρου, η ερευνητική ομάδα περιελάμβανε 299 ασθενείς με το στάδιο Ι-ΙΙΙ του καρκίνου του παχέος εντέρου που υποβλήθηκε σε χειρουργική επέμβαση ριζών και συγκέντρωσε δείγματα αίματος σε κάθε σημείο παρακολούθησης (τριών μηνών) μέσα σε μία εβδομάδα πριν από τη χειρουργική επέμβαση, δοκιμή ctdna.
Πρώτον, διαπιστώθηκε ότι η δοκιμή ctDNA θα μπορούσε να προβλέψει τον κίνδυνο υποτροπής σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου νωρίς, τόσο προεγχειρητικά όσο και πρώιμα μετεγχειρητικά. Οι προεγχειρητικοί ασθενείς με θετικό cTDNA είχαν μεγαλύτερη πιθανότητα μετεγχειρητικής υποτροπής από τους προεγχειρητικούς ασθενείς με αρνητικό ctDNA (22,0%> 4,7%). Οι πρώιμες μετεγχειρητικές δοκιμές ctDNA εξακολουθούν να προέβλεπαν τον κίνδυνο υποτροπής: ένα μήνα μετά την ριζική εκτομή, οι ασθενείς με CTDNA-θετικοί ήταν 17,5 φορές πιο πιθανό να επαναληφθούν από τους αρνητικούς ασθενείς. Η ομάδα διαπίστωσε επίσης ότι η συνδυασμένη δοκιμή ctDNA και CEA με ελαφρώς βελτιωμένη απόδοση στην ανίχνευση υποτροπής (AUC = 0,849), αλλά η διαφορά δεν ήταν σημαντική σε σύγκριση με το ctDNA (AUC = 0,839) μόνο η διαφορά δεν ήταν σημαντική σε σύγκριση με το ctDNA μόνο (AUC = 0,839).
Η κλινική σταδιοποίηση σε συνδυασμό με τους παράγοντες κινδύνου είναι σήμερα η βασική βάση για τη διαστρωμάτωση κινδύνου των καρκινοπαραγωγών ασθενών και στο σημερινό πρότυπο, ένας μεγάλος αριθμός ασθενών εξακολουθεί να επαναλαμβάνεται [4] και υπάρχει επείγουσα ανάγκη για καλύτερα εργαλεία διαστρωμάτωσης ως συνυπάρχουσες υπερβολικές θεραπείας και υποεκμετάλλευσης στην κλινική. Με βάση αυτό, η ομάδα ταξινόμησε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου σταδίου ΙΙΙ σε διαφορετικές υποομάδες που βασίζονται σε κλινική εκτίμηση κινδύνου υποτροπής (υψηλού κινδύνου (T4/ N2) και χαμηλού κινδύνου (T1-3N1)) και περίοδο θεραπείας ανοσοενισχυτικού (3/6 μήνες). Η ανάλυση διαπίστωσε ότι οι ασθενείς στην υποομάδα υψηλού κινδύνου των ασθενών με θετικό ctDNA είχαν χαμηλότερο ποσοστό υποτροπής εάν έλαβαν έξι μήνες θεραπείας ανοσοενισχυτικού. Στην υποομάδα χαμηλού κινδύνου των ασθενών με CTDNA-θετικά, δεν υπήρχε σημαντική διαφορά μεταξύ του κύκλου θεραπείας του ανοσοενισχυτικού και των αποτελεσμάτων των ασθενών. ενώ οι ασθενείς με αρνητικό ctDNA είχαν σημαντικά καλύτερη πρόγνωση από τους ασθενείς με θετικό ctDNA και μια μεγαλύτερη μετεγχειρητική περίοδο υποτροπής (RFS). Στάδιο Ι και καρκίνος του παχέος εντέρου σταδίου II, όλοι οι ασθενείς με αρνητικό ctDNA δεν είχαν υποτροπή εντός δύο ετών. Ως εκ τούτου, η ενσωμάτωση του cTDNA με κλινικά χαρακτηριστικά αναμένεται να βελτιστοποιήσει περαιτέρω τη διαστρωμάτωση κινδύνου και να προβλέψει καλύτερα την επανάληψη.

Εικόνα 1. Ανάλυση ctDNA στο πλάσμα στο POM1 για την έγκαιρη ανίχνευση της επανεμφάνισης του καρκίνου του παχέος εντέρου
Περαιτέρω αποτελέσματα δυναμικής δοκιμής ctDNA έδειξαν ότι ο κίνδυνος υποτροπής ήταν σημαντικά υψηλότερος σε ασθενείς με θετική δυναμική δοκιμή cTDNA από ό, τι σε ασθενείς με αρνητικό ctDNA κατά τη διάρκεια της φάσης παρακολούθησης της νόσου μετά την οριστική θεραπεία (μετά από ριζική χειρουργική επέμβαση + ανοσοενισχυτική θεραπεία) (Εικόνα 3acd) και ότι το ctDNA μπορεί να υποδηλώνει την υποτροπή του όγκου σε 20 μήνες νωρίτερα από την απεικόνιση (Εικόνα 3b) επανάληψη και έγκαιρη παρέμβαση.

Εικόνα 2. Ανάλυση ctDNA με βάση τη διαμήκη ομάδα για την ανίχνευση της υποτροπής του καρκίνου του παχέος εντέρου

"Ένας μεγάλος αριθμός μελετών μεταφραστικής ιατρικής στον καρκίνο του παχέος εντέρου οδηγεί την πειθαρχία, ιδίως τη δοκιμή MRD με βάση το ctDNA, αποδεικνύει μεγάλες δυνατότητες για την ενίσχυση της μετεγχειρητικής διαχείρισης ασθενών με καρκίνο του παχέος εντέρου, επιτρέποντας τη διαστρωμάτωση κινδύνου υποτροπής, την καθοδήγηση των αποφάσεων θεραπείας και την παρακολούθηση της πρώιμης υποτροπής.

Το πλεονέκτημα της επιλογής της μεθυλίωσης του DNA ως ενός νέου δείκτη MRD σχετικά με την ανίχνευση μετάλλαξης είναι ότι δεν απαιτεί διαλογή αλληλουχίας ολόκληρου του γονιδιώματος και κλωνικού αιμάτου.
Αυτή η μελέτη και άλλες σχετικές μελέτες επιβεβαιώνουν ότι η δοκιμή MRD που βασίζεται σε ctDNA είναι ο σημαντικότερος ανεξάρτητος παράγοντας κινδύνου για την επανάληψη του καρκίνου του παχέος εντέρου του σταδίου I-III και μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να καθοδηγήσει τις αποφάσεις της θεραπείας, συμπεριλαμβανομένης της "κλιμάκωσης" και της "υποβάθμισης" της ανοσοενισχυτικής θεραπείας MRD είναι ο σημαντικότερος ανεξάρτητος παράγοντας κινδύνου για την επανεμφάνιση μετά τη χειρουργική επέμβαση για το στάδιο Ι-ΙΙ του χρωματιστικού καρκίνου.
Το πεδίο του MRD εξελίσσεται ταχέως με μια σειρά καινοτόμων, εξαιρετικά ευαίσθητων και ειδικών προσδιορισμών που βασίζονται στην επιγενετική (μεθυλίωση DNA και θραύσματα) και τη γονιδιωματική (εξαιρετικά βαθιά στοχευμένη αλληλουχία ή αλληλουχία ολόκληρου γονιδιώματος). Αναμένουμε ότι το Coloraiq® εξακολουθεί να οργανώνει κλινικές μελέτες μεγάλης κλίμακας και μπορεί να γίνει ένας νέος δείκτης δοκιμών MRD που συνδυάζει την προσβασιμότητα, την υψηλή απόδοση και την οικονομική προσιτότητα και μπορεί να χρησιμοποιηθεί ευρέως στη συνήθη κλινική πρακτική ».
Αναφορές
[1] Mo S, Ye L, Wang D, Han L, Zhou S, Wang Η, Dai W, Wang Υ, Luo W, Wang R, Xu Υ, Cai S, Liu R, Wang Z, Cai G. Πρόωρη ανίχνευση μοριακής υπολειμμάτων και στρωματοποίηση κινδύνου για το στάδιο Ι έως τον III του καρκίνου του καρκίνου του κυκλοφορίας του όγκου DNA. Jama Oncol. 2023 20 Απριλίου.
[2] "Το βάρος της νόσου του καρκίνου του παχέος εντέρου στον κινεζικό πληθυσμό: έχει αλλάξει τα τελευταία χρόνια; , Κινέζικη Εφημερίδα της Επιδημιολογίας, Vol. 41, Νο. 10, Οκτώβριος 2020.
[3] Tarazona Ν, Gimeno-Valiente F, Gambardella V, et αϊ. Στόχευση αλληλουχίας επόμενης γενιάς του DNA του κυκλοφορούντος όγκου για την παρακολούθηση ελάχιστης υπολειμματικής νόσου στον εντοπισμένο καρκίνο του παχέος εντέρου. Ann Oncol. 1 Νοεμβρίου 2019 · 30 (11): 1804-1812.
[4] Taieb J, André T, Auclin Ε. Διευκόλληση της ανοσοενισχυτικής θεραπείας για μη μεταστατικό καρκίνο του παχέος εντέρου, νέα πρότυπα και προοπτικές. Ο καρκίνος Treat Rev. 2019, 75: 1-11.