Απόδοση τεσσάρων προσδιορισμών ενίσχυσης νουκλεϊκού οξέος για τον προσδιορισμό του SARS-COV-2 στην Αιθιοπία

Σας ευχαριστούμε που επισκεφθήκατε το Nature.com. Χρησιμοποιείτε μια έκδοση του προγράμματος περιήγησης με περιορισμένη υποστήριξη CSS. Για την καλύτερη εμπειρία, συνιστούμε να χρησιμοποιήσετε ένα ενημερωμένο πρόγραμμα περιήγησης (ή να απενεργοποιήσετε τη λειτουργία συμβατότητας στο Internet Explorer). Επιπλέον, για να εξασφαλίσουμε συνεχή υποστήριξη, παρουσιάζουμε τον ιστότοπο χωρίς στυλ και JavaScript.
Εμφανίζει ένα καρουσέλ τριών διαφανειών ταυτόχρονα. Χρησιμοποιήστε τα προηγούμενα και επόμενα κουμπιά για να μετακινηθείτε μέσα από τρεις διαφάνειες κάθε φορά ή χρησιμοποιήστε τα κουμπιά ολίσθησης στο τέλος για να μετακινηθείτε μέσα από τρεις διαφάνειες κάθε φορά.
Από την επιδημία του 2019 Coronavirus (COVID-19), έχουν αναπτυχθεί πολλές δοκιμασίες ενίσχυσης νουκλεϊκού οξέος (NAATs) σε όλο τον κόσμο και έχουν γίνει τυποποιημένες δοκιμασίες. Παρόλο που αρκετές δοκιμές αναπτύχθηκαν γρήγορα και εφαρμόστηκαν σε εργαστηριακές διαγνωστικές εξετάσεις, η απόδοση αυτών των δοκιμών δεν έχει αξιολογηθεί σε διάφορες ρυθμίσεις. Ως εκ τούτου, αυτή η μελέτη στοχεύει στην αξιολόγηση της απόδοσης των προσδιορισμών βιοτεχνολογίας Abbott SARS-COV-2, DAAN GENE, BGI και SANSURE χρησιμοποιώντας το σύνθετο πρότυπο αναφοράς (CRS). Η μελέτη διεξήχθη στο Ινστιτούτο Δημόσιας Υγείας της Αιθιοπίας (EPHI) από 1 έως 30 Δεκεμβρίου 2020. 164 δείγματα ρινοφαρυγγικών ρινοφαρυτικών εκχυλίστηκαν χρησιμοποιώντας το qiaamp RNA mini kit και το σύστημα παρασκευής δείγματος Abbott DNA. Από τα 164 δείγματα, το 59,1% ήταν θετικά και το 40,9% ήταν αρνητικά για το CRS. Η θετική βιοτεχνολογία Sansure ήταν σημαντικά χαμηλή σε σύγκριση με το CRS (P <0,05). Η θετική βιοτεχνολογία Sansure ήταν σημαντικά χαμηλή σε σύγκριση με το CRS (P <0,05). Положи πραγματοποιούμενοι ре реззззииииииim значλιού. Τα θετικά αποτελέσματα της Sansure Biotech ήταν σημαντικά χαμηλότερα σε σύγκριση με το CRS (P <0,05).与 crs 相比, sansure biotech 的阳性率显着较低 (p <0,05)。与 crs 相比, sansure biotech 的阳性率显着较低 (p <0,05)。 Η βιοτεχνολογική σας зоol значλί зожожажалыхных рзззззззззз ззжжжжыхных рзззззззззо зожожалыхных roззззззззззззззззззззззззззззззззззоо з з з з з з з з з з з з з з з з з з з з з з з з Η Sansure Biotech είχε σημαντικά λιγότερα θετικά αποτελέσματα σε σύγκριση με το CRS (P <0,05).Η συνολική συμφωνία των τεσσάρων αναλύσεων ήταν 96,3-100% σε σύγκριση με το CRS. Εκτός από το χαμηλό ποσοστό θετικότητας της δοκιμασίας βιοτεχνολογίας SANSURE, η απόδοση των τεσσάρων προσδιορισμών ήταν σχεδόν συγκρίσιμη. Ως εκ τούτου, η δοκιμασία Sansure Biotech [μόνο έρευνα (RUO)] απαιτεί πρόσθετη επικύρωση για τη χρήση της στην Αιθιοπία. Τέλος, θα πρέπει να ληφθούν υπόψη πρόσθετες έρευνες για την αξιολόγηση των προσδιορισμών με τους κατάλληλους ισχυρισμούς του κατασκευαστή.
Οι εργαστηριακές δοκιμές αποτελούν μέρος του Στρατηγικού Σχεδίου του Παγκόσμιου Οργανισμού Υγείας (WHO) για την ετοιμότητα και την ανταπόκριση της νόσου του Coronavirus 2019 (COVID-19). Ο οποίος συμβουλεύει ότι οι χώρες πρέπει να οικοδομήσουν εργαστηριακή ικανότητα για τη βελτίωση της ετοιμότητας, της κατάλληλης διαχείρισης των περιπτώσεων, της επαγρύπνησης και της ταχείας αντίδρασης στις προκλήσεις της δημόσιας υγείας. Αυτό υποδηλώνει ότι ο ρόλος του εργαστηρίου είναι το κλειδί για τον χαρακτηρισμό της ασθένειας και της επιδημιολογίας των αναδυόμενων μολυσματικών παραγόντων και τον έλεγχο της εξάπλωσής τους.
Η διάγνωση του COVID-19 απαιτεί επιδημιολογικές και ιατρικές πληροφορίες, προσωπικά συμπτώματα/σημεία και ακτινογραφικά και εργαστηριακά δεδομένα2. Δεδομένου ότι η επιδημία Covid-19 αναφέρθηκε στο Wuhan της Κίνας, έχουν αναπτυχθεί πολλές δοκιμές ενίσχυσης εμπορικών νουκλεϊκών οξέων (NAATs) σε όλο τον κόσμο. Η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης αντίστροφης μεταγραφής σε πραγματικό χρόνο (RRT-PCR) έχει χρησιμοποιηθεί ως συνήθη και τυπική μέθοδος για εργαστηριακή διάγνωση σοβαρής οξείας αναπνευστικής συνδρόμου 2 (SARS-COV-2) 3 μόλυνση. Η μοριακή ανίχνευση του SARS-CoV-2 βασίζεται τυπικά στο γονίδιο Ν (γονίδιο πρωτεΐνης Ν (γονίδιο πρωτεΐνης φακέλου) και γονίδια RDRP (RNA-εξαρτώμενα RNA πολυμεράσης) σε ORF1A/B (ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης 1Α/b). γονιδιακή) περιοχή που προσδιορίζεται από το ιικό γονιδίωμα. Θεωρούνται ότι είναι οι κύριες διατηρημένες περιοχές που βρίσκονται σε ιικά γονιδιώματα για αναγνώριση ιού. Μεταξύ αυτών των γονιδίων, τα γονίδια RDRP και Ε έχουν υψηλή αναλυτική ευαισθησία ανίχνευσης, ενώ το γονίδιο Ν έχει χαμηλή αναλυτική ευαισθησία5.
Η απόδοση των προσδιορισμών PCR μπορεί να ποικίλει ανάλογα με διάφορους παράγοντες όπως: αντιδραστήρια εκχύλισης, αντιδραστήρια ενίσχυσης/ανίχνευσης, μέθοδος εκχύλισης, ποιότητα της μηχανής PCR και άλλα όργανα. Από τον Απρίλιο του 2020, περισσότερες από 48 διαφορετικές διαγνωστικές συσκευές από εννέα χώρες έχουν λάβει άδεια χρήσης έκτακτης ανάγκης (EUA) για τη διάγνωση Covid-196. Στην Αιθιοπία, χρησιμοποιούνται περισσότερες από 14 πλατφόρμες PCR σε πραγματικό χρόνο για την ανίχνευση PCR του SARS-COV-2 σε 26 ιδρύματα δημόσιας υγείας, συμπεριλαμβανομένων των ABI 7500, Abbott M2000, Roche 48000 και Quant-Studio7. Επιπλέον, διατίθενται διάφορα κιτ δοκιμών PCR, όπως η δοκιμή Daan Gene, η δοκιμή Abbott SARS-Cov-2, η δοκιμή βιοτεχνολογίας SASSURE και η δοκιμή SARS-COV-2 BGI. Παρόλο που η RRT-PCR είναι ιδιαίτερα ευαίσθητη, ορισμένοι ασθενείς με COVID-19 αναφέρουν ψευδώς αρνητικά αποτελέσματα λόγω ανεπαρκών αντιγράφων του ιικού ριβονουκλεϊκού οξέος (RNA) σε δείγματα λόγω ακατάλληλης συλλογής, μεταφοράς, αποθήκευσης και χειρισμού και εργαστηριακών δοκιμών. όροι και ενέργειες του προσωπικού8. Επιπλέον, η ρύθμιση του δείγματος ή του ελέγχου, η ρύθμιση του κατωφλίου κύκλου (CT) και η διασταυρούμενη αντιδραστικότητα με άλλα παθογόνα νουκλεϊκά οξέα ή τα αδρανή/υπολειμματικά RNA SARS-COV-2 μπορεί να οδηγήσουν σε ψευδώς θετικά αποτελέσματα σε δοκιμασίες RRT-PCR9. Έτσι, είναι σαφές ότι οι δοκιμές PCR μπορούν πράγματι να εντοπίσουν τους φορείς των θραυσμάτων γονιδίων, καθώς δεν μπορούν να διακρίνουν καν μεταξύ πραγματικά ενεργών ιικών γονιδίων, έτσι ώστε οι δοκιμές να μπορούν να προσδιορίσουν μόνο τους φορείς και όχι τους ασθενείς10. Ως εκ τούτου, είναι σημαντικό να αξιολογήσουμε τη διαγνωστική απόδοση χρησιμοποιώντας τυπικές μεθόδους στη ρύθμισή μας. Αν και πολλά αντιδραστήρια NAAT είναι διαθέσιμα στο Αιθιοπικό Ινστιτούτο Δημόσιας Υγείας (EPHI) και σε ολόκληρη τη χώρα, δεν έχει ακόμη αναφερθεί συγκριτική αξιολόγηση της αποτελεσματικότητάς τους. Ως εκ τούτου, αυτή η μελέτη στοχεύει στην αξιολόγηση της συγκριτικής απόδοσης των εμπορικά διαθέσιμων κιτ για την ανίχνευση του SARS-COV-2 με RRT-PCR χρησιμοποιώντας κλινικά δείγματα.
Συνολικά 164 συμμετέχοντες με υποψία COVID-19 συμπεριλήφθηκαν σε αυτή τη μελέτη. Η πλειονότητα των δειγμάτων προέρχεται από κέντρα θεραπείας (118/164 = 72%), ενώ οι υπόλοιποι 46 (28%) συμμετέχοντες προέρχονταν από κέντρα μη θεραπείας. Μεταξύ των συμμετεχόντων που δεν υποβλήθηκαν σε θεραπεία στο κέντρο, 15 (9,1%) είχαν κλινικά υποψίες και 31 (18,9%) είχαν επαφές επιβεβαιωμένων περιπτώσεων. Ενενήντα τρεις (56,7%) συμμετέχοντες ήταν άνδρες και η μέση ηλικία (± SD) των συμμετεχόντων ήταν 31,10 (± 11,82) έτη.
Σε αυτή τη μελέτη προσδιορίστηκαν θετικά και αρνητικά ποσοστά τεσσάρων δοκιμών για το COVID-19. Έτσι, τα θετικά ποσοστά της δοκιμασίας Abbott SARS-COV-2, η δοκιμασία Daan Gene 2019-NCOV, η δοκιμασία SARS-COV-2 BGI και η δοκιμασία SANSURE BIOTECH 2019-NCOV ήταν 59,1%, 58,5%, 57,9% και 55,5% αντίστοιχα. Οι βαθμολογίες θετικής και αρνητικής σύνθετης αναφοράς (CRS) ήταν 97 (59,1%) και 67 (40,9%), αντίστοιχα (Πίνακας 1). Σε αυτή τη μελέτη, ο ορισμός του CRS βασίστηκε στον "θετικό" κανόνα, όπου από τέσσερα αποτελέσματα των δοκιμών, δύο ή περισσότερα αποτελέσματα δοκιμών που έδωσαν το ίδιο αποτέλεσμα θεωρήθηκαν αληθινά θετικά ή αρνητικά.
Σε αυτή τη μελέτη, βρήκαμε μια αρνητική ποσοστιαία συμφωνία (NPA) 100% (95% CI 94,6-100) για όλες τις αναλύσεις σε σύγκριση με το CRS. Η ανάλυση βιοτεχνολογίας SANSURE έδειξε ένα ελάχιστο PPA 93,8% (95% CI 87,2-97,1) και η ανάλυση DAAN GENE 2019-NCOV είχε συνολική συμφωνία 99,4% (95% CI 96,6-99,9). Αντίθετα, η συνολική συμφωνία μεταξύ της δοκιμασίας BGI SARS-COV-2 και της δοκιμασίας SANSURE BIOTECH 2019-NCOV ήταν 98,8% και 96,3% αντίστοιχα (Πίνακας 2).
Ο συντελεστής συμφωνίας του Kappa της Cohen μεταξύ CRS και Abbott SARS-COV-2, τα αποτελέσματα ήταν πλήρως συνεπή (k = 1,00). Ομοίως, οι τιμές Kappa του Cohen ανιχνεύθηκαν από το Daan Gene 2019-NCOV, το SARS-COV-2 BGI και το Sansure Biotech 2019-NCOV είναι επίσης πλήρως συνεπείς με το CRS (K ≥ 0,925). Σε αυτή τη συγκριτική ανάλυση, η δοκιμή Chi-square (δοκιμή McNemar) έδειξε ότι τα αποτελέσματα της δοκιμασίας Sansure Biotech 2019-NCOV ήταν σημαντικά διαφορετικά από τα αποτελέσματα CRS (P = 0,031) (Πίνακας 2).
Όπως φαίνεται στο ΣΧ.1 Το ποσοστό της χαμηλότερης τιμής CT (<20 ct) της δοκιμασίας Abbott SARS-CoV-2 (συνδυασμένο γονίδιο RDRP και Ν) ήταν 50,6% και η τιμή CT (36-40 CT) ήταν 3,2%. 1 Το ποσοστό της χαμηλότερης τιμής CT (<20 ct) της δοκιμασίας Abbott SARS-CoV-2 (συνδυασμένο γονίδιο RDRP και Ν) ήταν 50,6% και η τιμή CT (36-40 CT) ήταν 3,2%.Όπως φαίνεται στο ΣΧ.(<20 ct) аиза Abbott SARS-COV-2 (кинирφυλακe 87,6%, Orf1a/b аналλί Biotech 2019-ncov поrз .. ч ч п н н н ч ч з з з з з з з з з з з з з œ Σχεράστε 3,2%. 1, το ποσοστό της ανάλυσης της χαμηλότερης τιμής CT (<20 CT) του Abbott SARS-Cov-2 (συνδυασμένο γονίδιο RDRP και Ν) ήταν 87,6%και η τιμή CT του ORF1A/B ανάλυση του Sansure Biotech 2019-NCOV έδειξε ότι το ποσοστό χαμηλής τιμής CT (<20 CT) αντιπροσώπευε για 3,2%.如图1 所示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20 Ct）为87.6%，Sansure Biotech 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%，高Ct 值(36–40 Ct) 的百分比为3.2%。 Όπως φαίνεται στο σχήμα 1, το χαμηλότερο ποσοστό τιμής CT (<20 CT) της δοκιμής Abbott SARS-Cov-2 (συνδυασμός RDRP και Ν γονιδίου) είναι 87,6%, η τιμή CT CT (36-4 CT). Κοιτάζοντας το паланана на руунзалал зиз abbott sars-cov-2 (сететай нены rdrp и и и з ч ч ч ч ч ч ζί. Το 87,6%, το A з значение ct гена orf1a/b ~ и и н н τροφή CT. Όπως φαίνεται στο σχήμα 1, η δοκιμασία Abbott SARS-COV-2 (που συνδυάζει τα γονίδια RDRP και Ν) είχε τη χαμηλότερη ποσοστιαία τιμή CT (<20 CT) στο 87,6%, ενώ η τιμή CT του γονιδίου ORF1A/B στη μελέτη SANSURE BIOTECH 2019-η ανάλυση του NCOV έδειξε χαμηλή CT. (<20 ct) соценав зеначеначений ct (36-40 CT) Το ποσοστό των τιμών (<20 ct) ήταν 50,3%και το ποσοστό των υψηλών τιμών CT (36-40 ct) ήταν 3,2%.Η δοκιμή Abbott SARS-COV-2 B καταγράφηκε τιμές CT πάνω από 30. Από την άλλη πλευρά, στη δοκιμασία BGI SARS-COV-2 ORF1A/B γονίδιο είχε υψηλό ποσοστό τιμής CT (> 36 CT) ήταν 4% (Σχήμα 1). Από την άλλη πλευρά, στη δοκιμασία BGI SARS-COV-2 ORF1A/B γονίδιο είχε υψηλό ποσοστό τιμής CT (> 36 CT) ήταν 4% (Σχήμα 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составлял 4% (рис. 1). Από την άλλη πλευρά, στην ανάλυση του BGI SARS-COV-2 γονιδίου ORF1A/B είχε υψηλή τιμή CT (> 36 CT), το ποσοστό των οποίων ήταν 4% (Εικόνα 1).另一方面 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 在 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 的百分比为 4%(图 1)。 Από την άλλη πλευρά, στην ανίχνευση BGI SARS-COV-2, το ποσοστό του γονιδίου ORF1A/B με υψηλή τιμή CT (> 36 CT) είναι 4% (Εικόνα 1). С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 процент генов ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (рис. 1). Από την άλλη πλευρά, στην ανάλυση BGI SARS-COV-2, το ποσοστό των γονιδίων ORF1A/B με υψηλές τιμές CT (> 36 CT) ήταν 4% (Σχήμα 1).
Σε αυτή τη μελέτη, πήραμε 164 ρινοφαρυγγικά δείγματα. Για όλους τους τύπους προσδιορισμών, πραγματοποιήθηκε απομόνωση και ενίσχυση RNA χρησιμοποιώντας τις μεθόδους και τα κιτ που συνιστώνται από τους αντίστοιχους κατασκευαστές.
Αυτή η μελέτη έδειξε ότι η δοκιμή του Abbott για το SARS-COV-2 έχει την ίδια απόδοση ανίχνευσης με το CRS, με 100% θετική, αρνητική και συνολική συμφωνία. Η συμφωνία Kappa του Cohen είναι 1,00, υποδεικνύοντας την πλήρη συμφωνία με την CRS. Μια παρόμοια μελέτη του Πανεπιστημίου της Ουάσινγκτον στις ΗΠΑ διαπίστωσε ότι η συνολική ευαισθησία και η εξειδίκευση της δοκιμής ABBOTT για το SARS-COV-2 ήταν 93% και 100%, αντίστοιχα, σε σύγκριση με τον προσδιορισμό εργαστηριακού προσδιορισμού (LDA) του CDC. 11. Το σύστημα ανίχνευσης Abbott SARS-COV-2 βασίζεται στην ταυτόχρονη συνδυασμένη ανίχνευση των γονιδίων Ν και RDRP, καθώς και τα δύο γονίδια είναι πιο ευαίσθητα, ελαχιστοποιώντας τα ψευδή αρνητικά12. Μια μελέτη στη Βιέννη, η Αυστρία έδειξε επίσης ότι οι μεγάλοι όγκοι δείγματος εκχύλισης και οι όγκοι της ανίχνευσης ελαχιστοποιούν τα αποτελέσματα της αραίωσης και την αυξημένη απόδοση ανίχνευσης13. Έτσι, η τέλεια αντιστοίχιση του Abbott για τη δοκιμασία SARS-COV-2 μπορεί να συσχετιστεί με ένα σύστημα ανίχνευσης πλατφόρμας που ανιχνεύει ταυτόχρονα συνδυαστικά γονίδια, εκχυλίζει μεγάλο αριθμό δειγμάτων (0,5 mL) και χρησιμοποιεί μεγάλη ποσότητα έκλουσης (40 μΐ).
Τα αποτελέσματά μας έδειξαν επίσης ότι η απόδοση ανίχνευσης του γενετικού τεστ Daan ήταν σχεδόν η ίδια με αυτή του CRS. Αυτό είναι σύμφωνο με μια μελέτη14 που διεξήχθη στο Πανεπιστήμιο Anhui στο Huainan της Κίνας και τον ισχυρισμό του κατασκευαστή για 100% θετική συμφωνία. Παρά τις αναφορές των συνεπών αποτελεσμάτων, ένα δείγμα ήταν ψευδές αρνητικό μετά την επανεξέταση του ίδιου έκλουσματος, αλλά ήταν θετική στις δοκιμασίες Abbott SARS-COV-2 και Sansure Biotech NCOV-2019. Αυτό υποδηλώνει ότι μπορεί να υπάρχει μεταβλητότητα στα αποτελέσματα σε διάφορους τύπους προσδιορισμών. Παρ 'όλα αυτά, στη μελέτη που διεξήχθη στην Κίνα15, το αποτέλεσμα της προσδιορισμού γονιδίου DAAN ήταν σημαντικά διαφορετικό (P <0,05) σε σύγκριση με τον προσδιορισμό αναφοράς που καθορίστηκε από το εργαστήριο. Παρ 'όλα αυτά, στη μελέτη που διεξήχθη στην Κίνα15, το αποτέλεσμα της προσδιορισμού γονιδίου DAAN ήταν σημαντικά διαφορετικό (P <0,05) σε σύγκριση με τον προσδιορισμό αναφοράς που καθορίστηκε από το εργαστήριο. Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) от их лаборатррногο э э э э э э а а а а а а а а а а а а а а а л л л л л л л л л л л л л л л л л л л л л л л л Ωστόσο, σε μια μελέτη στην Κίνα15, το αποτέλεσμα της ανάλυσης του Daan Gene ήταν σημαντικά διαφορετικό (P <0,05) από την ανάλυση αναφοράς εργαστηρίου τους.然而 ， 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异 (p <0,05)。然而 ， 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差 <0,05 Онн ееееччччччч п ч ч ч р р р œ сравнению с е е э э э э э э э э л л л л л л л л л л л л л л л л л л л л Ωστόσο, σε μια μελέτη στην Κίνα15, τα αποτελέσματα της γενετικής εξέτασης του Daan ήταν σημαντικά διαφορετικά (P <0,05) σε σύγκριση με το εργαστηριακό της τεστ αναφοράς.Αυτή η ασυμφωνία μπορεί να οφείλεται στην ευαισθησία της δοκιμής αναφοράς για την ανίχνευση SARS-COV-2 και περαιτέρω μελέτες μπορεί να είναι σημαντικές για τον προσδιορισμό της αιτίας.
Επιπλέον, η μελέτη μας αξιολόγησε τη συγκριτική απόδοση της δοκιμασίας BGI SARS-COV-2 με CRS, δείχνοντας εξαιρετική θετική ποσοστιαία συμφωνία (PPA = 97,9%), αρνητική ποσοστιαία συμφωνία (NPA = 100%) και συνολική ποσοστιαία συμφωνία ανά φύλο (OPA). ). = 98,8%). Οι τιμές Kappa του Cohen έδειξαν καλή συμφωνία (k = 0.975). Μελέτες στις Κάτω Χώρες16 και την Κίνα15 έχουν δείξει συνεπή αποτελέσματα. Η δοκιμή BGI SARS-COV-2 είναι μία δοκιμή ανίχνευσης μόνο γονιδίου (ORF1A/B) χρησιμοποιώντας 10 μΐ ενίσχυσης/ανίχνευσης. Παρά την καλή στατιστική συμφωνία με τα αποτελέσματα αναφοράς, η ανάλυση έχασε δύο θετικά δείγματα (1,22%) του συνολικού δείγματος. Αυτό μπορεί να έχει τεράστιες κλινικές επιπτώσεις στη δυναμική μετάδοσης τόσο σε επίπεδο ασθενούς όσο και σε κοινοτικό επίπεδο.
Μια άλλη συγκριτική ανάλυση που συμπεριλήφθηκε σε αυτή τη μελέτη ήταν η δοκιμασία SANSURE BIOTECH NCOV-2019 RRT-PCR (RUO). Το συνολικό ποσοστό αγώνα ήταν 96,3%. Η δύναμη της συμφωνίας καθορίστηκε επίσης από την τιμή Kappa του Cohen, η οποία ήταν 0,925, υποδεικνύοντας πλήρη συμφωνία με το CRS. Και πάλι, τα αποτελέσματά μας είναι πανομοιότυπα με τις μελέτες που διεξήχθησαν στο Κεντρικό Νότιο Πανεπιστήμιο στο Changsha της Κίνας και στο Τμήμα Κλινικών Εργαστηρίων του Λαϊκού Νοσοκομείου Liuzhou, Liuzhou City, China17. Παρόλο που καταγράφηκε η παραπάνω καλή στατιστική συμφωνία, η δοκιμή Chi-square (δοκιμή MacNemar) έδειξε ότι το αποτέλεσμα της δοκιμασίας βιοτεχνολογίας Sansure είχε στατιστικά σημαντική διαφορά σε σύγκριση με CRs (P <0,005). Παρόλο που καταγράφηκε η παραπάνω καλή στατιστική συμφωνία, η δοκιμή Chi-square (δοκιμή MacNemar) έδειξε ότι το αποτέλεσμα της δοκιμασίας βιοτεχνολογίας Sansure είχε στατιστικά σημαντική διαφορά σε σύγκριση με CRs (P <0,005). Не ниафазазаззεριe хе х р ш ш х х х х τροφή- (к п п п п п п п п п з з з з з з з п п п п п п п п п п п п п п п п п п п п п п œ 0,005). Παρόλο που καταγράφηκε η καλή στατιστική συμφωνία, η δοκιμή Chi-square (δοκιμή McNemar) έδειξε ότι το αποτέλεσμα της δοκιμασίας βιοτεχνολογίας SANSURE είχε στατιστικά σημαντική διαφορά σε σύγκριση με το CRS (P <0,005).尽管记录了上述良好的统计一致性 ， 但卡方检验 (MacNemar 检验) 表明, Sansure Biotech 检测的结果与 Crs 相比具有统计学显着差异 (P <0,005)。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 一致性 但 但 检验 检验 检验 与 与 与 与 与 与 与 与 与 相比 相比 具有 具有 与 与 与 与 与 与 与 与 与 与 与 与 与 与 Не нченышехехехе х х р ш τήρι с р ч ыш р р р р х х х х х х œ (P <0,005) жу аизом Sansure Biotech и crs. Παρά την καλή στατιστική συμφωνία που σημειώθηκε παραπάνω, η δοκιμή Chi-square (δοκιμή McNemar) έδειξε στατιστικά σημαντική διαφορά (P <0,005) μεταξύ της δοκιμασίας βιοτεχνολογίας Sansure και των CRs.Έξι δείγματα (3,66%) βρέθηκαν να είναι ψευδή αρνητικά σε σύγκριση με το CRS (Συμπληρωματικός Πίνακας 1). Αυτό είναι πολύ σημαντικό, ειδικά δεδομένης της δυναμικής της μετάδοσης του ιού. Τα παραπάνω δεδομένα υποστηρίζουν επίσης αυτό το χαμηλό ρυθμό ανίχνευσης15.
Σε αυτή τη μελέτη προσδιορίστηκαν οι τιμές CT για κάθε δοκιμασία και την αντίστοιχη πλατφόρμα, με τη χαμηλότερη μέση τιμή CT που αναφέρθηκε στον προσδιορισμό Abbott SARS-COV-2. Αυτό το αποτέλεσμα μπορεί να σχετίζεται με το ταυτόχρονο συνδυασμένο σύστημα γενετικών δοκιμών της Abbott για την ανίχνευση του SARS-COV-2. Επομένως, σύμφωνα με το Σχήμα 1, το 87,6% των αποτελεσμάτων Abbott SARS-COV-2 είχαν τιμές CT κάτω από 20. Μόνο ένας μικρός αριθμός αποτελεσμάτων δείγματος (12,4%) ήταν στην περιοχή 20-30. Οι τιμές CT πάνω από 30 δεν καταγράφηκαν. Εκτός από τη χρήση του Abbott από τη μορφή γενετικής δοκιμής SARS-COV-2, αυτό το αποτέλεσμα μπορεί να σχετίζεται με το χαμηλότερο όριο ανίχνευσης (32,5 RNA αντίγραφα/mL) 18, το οποίο είναι τρεις φορές χαμηλότερο από το κατώτερο όριο της εταιρείας 100 αντιγράφων RNA/ml. ML) 19.
Αυτή η μελέτη έχει ορισμένους περιορισμούς: Πρώτον, δεν έχουμε μέθοδοι τυποποιημένης/αναφοράς [όπως το ιικό φορτίο ή άλλες εργαστηριακές δοκιμές (LDA)] λόγω έλλειψης πόρων. Δεύτερον, όλα τα δείγματα που χρησιμοποιήθηκαν σε αυτή τη μελέτη ήταν ρινοφαρυγγικά επιχρίσματα, ενώ τα αποτελέσματα δεν ήταν εφαρμόσιμα σε άλλους τύπους δειγμάτων και τρίτον, το μέγεθος του δείγματος μας ήταν μικρό.
Αυτή η μελέτη συνέκρινε την απόδοση τεσσάρων προσδιορισμών RRT-PCR για SARS-COV-2 χρησιμοποιώντας ρινοφαρυγγικά δείγματα. Όλες οι δοκιμασίες ανίχνευσης είχαν σχεδόν συγκρίσιμη απόδοση, με εξαίρεση τον προσδιορισμό βιοτεχνολογίας SANSURE. Εκτός αυτού, ο χαμηλός ρυθμός θετικότητας ταυτοποιήθηκε στη δοκιμασία βιοτεχνολογίας SANSURE σε σύγκριση με το CRS (P <0,05). Εκτός αυτού, ο χαμηλός ρυθμός θετικότητας ταυτοποιήθηκε στη δοκιμασία βιοτεχνολογίας SANSURE σε σύγκριση με το CRS (P <0,05). Κοιτάζοντας το Sansure Biotech ы ы ы н н н н 20.05). Επιπλέον, η δοκιμή βιοτεχνολογίας SANSURE έδειξε χαμηλό ποσοστό θετικών αποτελεσμάτων σε σύγκριση με το CRS (P <0,05).此外 与 与 crs 相比, sansure biotech 检测的阳性率较低 (p <0,05)。此外 与 与 crs 相比, sansure biotech 检测的阳性率较低 (p <0,05)。 Κοιτάζοντας, аниз sansure biotech иел бее τεύας неззй уровень пожатжжжыхыхыхыхыхзззззззззззззз у п п р р н н н œ Επιπλέον, η δοκιμασία βιοτεχνολογίας SANSURE είχε χαμηλότερο ποσοστό θετικότητας σε σύγκριση με το CRS (P <0,05).Η ανάλυση SANSURE BIOTECH NCOV-2019 (RUO) της PPA, της NPA και της συνολικής συμφωνίας υπερέβη το 93,5% με δύναμη Cohen Kappa αξίας συμφωνίας 0,925. Τέλος, ο προσδιορισμός βιοτεχνολογίας SANSURE (RUO) χρειάζεται περαιτέρω επικύρωση για χρήση στην Αιθιοπία και θα πρέπει να ληφθεί υπόψη πρόσθετες έρευνες για την αξιολόγηση αξιώσεων από μεμονωμένους κατασκευαστές.
Ο σχεδιασμός συγκριτικής μελέτης διεξήχθη σε τέσσερις εγκαταστάσεις υγείας στο Addis Ababa, στο νοσοκομείο Eka Kotebe, στο κέντρο θεραπείας της χιλιετίας, στο νοσοκομείο Zewooditu Memorial και στο Νοσοκομείο Ειδικής Φυματίωσης του Αγίου Πέτρου. Τα δεδομένα συλλέχθηκαν μεταξύ της 1ης και της 31ης Δεκεμβρίου 2020. Οι ιατρικές εγκαταστάσεις αυτής της μελέτης επιλέχθηκαν σκόπιμα με βάση τον μεγάλο αριθμό των περιπτώσεων και τη διαθεσιμότητα μεγάλων κέντρων θεραπείας στην πόλη. Παρομοίως, επιλέχθηκαν όργανα ABI 7500 και Abbott M2000 σε πραγματικό χρόνο, επιλέχθηκαν σύμφωνα με τις συστάσεις των κατασκευαστών αντιδραστηρίων NAAT και επιλέχθηκαν τέσσερα κιτ ανίχνευσης PCR για τη μελέτη αυτή, καθώς τα περισσότερα εργαστήρια στην Αιθιοπία χρησιμοποιήθηκαν τουλάχιστον τουλάχιστον τέσσερις από αυτές. Δοκιμή γονιδίων, δοκιμή Abbott SARS-COV-2, δοκιμή βιοτεχνολογίας SASSURE και δοκιμή SARS-COV-2 BGI που πραγματοποιήθηκε κατά τη διάρκεια της μελέτης).
Η δοκιμή για το SARS-COV-2 διεξήχθη από 1 έως 30 Δεκεμβρίου 2020 χρησιμοποιώντας 3 mL μέσου μεταφοράς ιού (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, Κίνα) από άτομα υπό έρευνα για το Covid-19 που αναφέρεται στο Ephi. Τα ρινοφαρυγγικά δείγματα συλλέχθηκαν από εκπαιδευμένους συλλέκτες δειγμάτων και στάλθηκαν στο Ephi σε τριπλές συσκευασίες. Πριν από την απομόνωση του νουκλεϊκού οξέος, κάθε δείγμα αποδίδεται ένας μοναδικός αριθμός αναγνώρισης. Η εκχύλιση εκτελείται από κάθε δείγμα αμέσως μετά την άφιξη χρησιμοποιώντας χειροκίνητες και αυτόματες μεθόδους εξαγωγής. Έτσι, για την αυτόματη εξαγωγή Abbott M2000, 1,3 mL (συμπεριλαμβανομένων των 0,8 ml νεκρού όγκου και 0,5 ml όγκου εισόδου εκχύλισης) του δείγματος εκχυλίστηκε από κάθε δείγμα και διέρχεται από το σύστημα παρασκευής δείγματος Abbott DNA (Abbott Molecular Inc. Des Plaines, IL, USA). ) Μια παρτίδα 96 [92 δειγμάτων, δύο ελέγχους ανίχνευσης και δύο ελέγχους μη προβολής (NTC)] συμπεριλήφθηκε στη συνολική διαδικασία (ανάκτηση και ανίχνευση) δύο γύρους SARS-COV-2 (EUA) σε πραγματικό χρόνο. εξόρυξη. Ομοίως, για χειροκίνητη εξαγωγή, χρησιμοποιήστε τα ίδια δείγματα (για αυτόματη εξαγωγή και ανακάλυψη). Έτσι, καθ 'όλη τη διάρκεια της διαδικασίας, τα δείγματα 140 μΐ σφραγίστηκαν και εξήχθησαν χρησιμοποιώντας το κιτ QIAAMP ιικού RNA Mini (Qiagen GmbH, Hilden, Germany) σε παρτίδες 24 (συμπεριλαμβανομένων 20 δειγμάτων, δύο ελέγχων δοκιμής και δύο NTCs) πάνω από εννέα γύρους. Οι εκχυλισμένες εκχυλισμένες με το χέρι ενισχύθηκαν και ανιχνεύθηκαν χρησιμοποιώντας έναν θερμικό κυκλοποιητή ABI 7500 χρησιμοποιώντας δοκιμασία SARS-CoV-2 BGI, δοκιμασία γονιδίου Daan και δοκιμασία βιοτεχνολογίας SANSURE.
Η αυτοματοποιημένη απομόνωση και ο καθαρισμός του ιικού RNA SARS-COV-2 ακολουθεί την αρχή του μαγνητικού σφαιριδίου χρησιμοποιώντας αντιδραστήρια παρασκευής δείγματος Abbott DNA. Η απενεργοποίηση των δειγμάτων και η διαλυτοποίηση των ιικών σωματιδίων διεξάγονται χρησιμοποιώντας ένα απορρυπαντικό που περιέχει ισοθειοκυανικό γουανιδίνης για να μεριγνώσει την πρωτεΐνη και να απενεργοποιήσει την RNase. Το RNA στη συνέχεια διαχωρίζεται από την πρωτεΐνη με διαχωρισμό στερεάς φάσης χρησιμοποιώντας πυριτικό, δηλαδή το άλας γουανιδινίου και το αλκαλικό ρΗ του ρυθμιστικού λύσης της λύσης προάγει τη δέσμευση των νουκλεϊνικών οξέων στο σίλικα (SiO2). Το βήμα έκπλυσης αφαιρεί τις υπόλοιπες πρωτεΐνες και τα συντρίμμια για να παράγουν ένα σαφές διάλυμα. Το διαφανές RNA απομονώνεται από μικροσωματίδια που βασίζονται σε πυριτία χρησιμοποιώντας το μαγνητικό πεδίο του οργάνου 20,21. Από την άλλη πλευρά, η χειροκίνητη απομόνωση και ο καθαρισμός του RNA διεξάγεται με τη μέθοδο της στήλης περιστροφής χρησιμοποιώντας φυγοκέντρηση αντί για μαγνητικό περίπτερο και διαχωρισμό μικροσωματιδίων από την έκλουστη.
Η δοκιμή ανίχνευσης SARS-COV-2 σε πραγματικό χρόνο (Abbott Molecular, Inc.) πραγματοποιήθηκε σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή, οι οποίες έλαβαν EUA19,22 από την WHO και την FDA. Σε αυτό το πρωτόκολλο, η απενεργοποίηση του δείγματος πριν από την εκχύλιση πραγματοποιήθηκε σε υδατόλουτρο στους 56 ° C για 30 λεπτά. Μετά την απενεργοποίηση του ιού, η εκχύλιση νουκλεϊκού οξέος πραγματοποιήθηκε σε όργανο Abbott M2000 SP από 0,5 ml VTM χρησιμοποιώντας ένα σύστημα παρασκευής δείγματος Abbott M2000 DNA. Σύμφωνα με τον κατασκευαστή. Η ενίσχυση και η ανίχνευση πραγματοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας ένα όργανο Abbott M2000 RT-PCR και διεξήχθη διπλή ανίχνευση για τα γονίδια RDRP και Ν. ROX) και VIC P (ιδιόκτητη βαφή) για στόχευση και ανίχνευση εσωτερικών ελέγχων, επιτρέποντας ταυτόχρονη ανίχνευση και των δύο προϊόντων ενίσχυσης 19.
Η μέθοδος ανίχνευσης ενίσχυσης αυτού του κιτ βασίζεται στην τεχνολογία RT-PCR ενός βήματος. Τα γονίδια ORF1A/B και N επιλέχθηκαν ως διατηρημένες περιοχές από την τεχνολογία Daan Gene για την ανίχνευση της ενίσχυσης της περιοχής -στόχου. Ειδικοί εκκινητές και ανιχνευτές φθορισμού (ανιχνευτές γονιδίων Ν που επισημαίνονται με FAM, ORF1A/B ανιχνευτές που επισημαίνονται με VIC) έχουν σχεδιαστεί για να ανιχνεύουν RNA SARS-CoV-2 σε δείγματα. Τα τελικά μίγματα έκλουσης και κύριας παρασκευάστηκαν προσθέτοντας 5 μΐ έκλουσης σε 20 μΐ του κύριου μίγματος σε τελικό όγκο 25 μΐ. Η ενίσχυση και η ανίχνευση πραγματοποιήθηκαν ταυτόχρονα σε ένα όργανο PCR σε πραγματικό χρόνο ABI 750024.
Τα γονίδια ORF1A/B και N ανιχνεύθηκαν χρησιμοποιώντας το Sansure Biotech NCOV-2019 Nucleic Acid Diagnostic Kit (ανίχνευση φθορισμού PCR). Προετοιμάστε συγκεκριμένους ανιχνευτές για κάθε γονίδιο στόχου επιλέγοντας το κανάλι FAM για την περιοχή ORF1A/B και το κανάλι ROX για το γονίδιο Ν. Σε αυτό το κιτ προσδιορισμού, τα αντιδραστήρια ELUENT και MASTER MIX προστίθενται ως εξής: Προετοιμασία αντιδραστηρίου Master Mix 30 μΐ και 20 μΐ εκλούσματος δείγμα για ανίχνευση/ενίσχυση. Το PCR σε πραγματικό χρόνο ABI 750025 χρησιμοποιήθηκε για ενίσχυση/ανίχνευση.
Η δοκιμή BGI SARS-COV-2 είναι ένα φθορίζον κιτ RRT-PCR σε πραγματικό χρόνο για τη διάγνωση του COVID-19. Η περιοχή στόχου βρίσκεται στην περιοχή ORF1A/B του γονιδιώματος SARS-COV-2, το οποίο είναι μία μέθοδος ανίχνευσης γονιδίων. Επιπλέον, το γονίδιο της ανθρώπινης νοικοκυράς β-ακτίνη είναι ένα εσωτερικά ρυθμισμένο γονίδιο στόχου. Το κύριο μίγμα παρασκευάζεται με ανάμειξη 20 μΐ του αντιδραστηρίου κύριου μίγματος και 10 μΐ του εκχυλισμένου δείγματος RNA σε πλάκα φρεατίου26. Χρησιμοποιήθηκε ένα ποσοτικό ποσοτικό ποσοτικό ποσοτικό σε πραγματικό χρόνο χρησιμοποιήθηκε ένα όργανο PCR σε πραγματικό χρόνο για ενίσχυση και ανίχνευση. Όλες οι ενίσχυση του νουκλεϊκού οξέος, οι συνθήκες εκτέλεσης PCR για κάθε δοκιμασία και η ερμηνεία των αποτελεσμάτων πραγματοποιήθηκαν σύμφωνα με τις οδηγίες του αντίστοιχου κατασκευαστή (Πίνακας 3).
Σε αυτή τη συγκριτική ανάλυση, δεν χρησιμοποιήσαμε την πρότυπη μέθοδο αναφοράς για τον προσδιορισμό της ποσοστιαίας συμφωνίας (θετικής, αρνητικής και συνολικής) και άλλων παραμέτρων σύγκρισης για τις τέσσερις αναλύσεις. Κάθε σύγκριση δοκιμών έγινε με CRS, σε αυτή τη μελέτη το CRS καθορίστηκε από τον κανόνα "οποιοδήποτε θετικό" και το αποτέλεσμα προσδιορίστηκε, όχι με μία μόνο δοκιμή, χρησιμοποιήσαμε τουλάχιστον δύο αντιστοιχισμένα αποτελέσματα δοκιμών. Επιπλέον, στην περίπτωση της μετάδοσης Covid-19, τα ψευδή αρνητικά αποτελέσματα είναι πιο επικίνδυνα από τα ψευδώς θετικά αποτελέσματα. Επομένως, για να πούμε "θετικό" όσο το δυνατόν ακριβέστερα από ένα αποτέλεσμα CRS, τουλάχιστον δύο δοκιμές προσδιορισμού πρέπει να είναι θετικές, πράγμα που σημαίνει ότι τουλάχιστον ένα θετικό αποτέλεσμα είναι πιθανό να προέλθει από μια δοκιμασία EUA. Έτσι, από τα τέσσερα αποτελέσματα των δοκιμών, δύο ή περισσότερα αποτελέσματα δοκιμών που δίνουν το ίδιο αποτέλεσμα θεωρούνται αληθινά θετικά ή αρνητικά18,27.
Τα δεδομένα συλλέχθηκαν χρησιμοποιώντας δομημένες φόρμες εκχύλισης δεδομένων, καταχώρηση και ανάλυση δεδομένων πραγματοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας το στατιστικό λογισμικό Excel και το SPSS έκδοση 23.0 για περιγραφικά στατιστικά στοιχεία. Θετική, αρνητική και συνολική ποσοστιαία συμφωνία αναλύθηκε και χρησιμοποιήθηκε βαθμολογία κάππα για τον προσδιορισμό του βαθμού συμφωνίας κάθε μεθόδου με CRS. Οι τιμές Kappa ερμηνεύονται ως εξής: 0,01 έως 0,20 για ήπια συμφωνία, 0,21 έως 0,40 για γενική συμφωνία, 0,41-0,60 για μέτρια συμφωνία, 0,61-0,80 για σημαντική συμφωνία και 0,81-0,99 για πλήρη συμφωνία28.
Η ηθική εκκαθάριση ελήφθη από το Πανεπιστήμιο της Αντίς Αμπέμπα και όλα τα πειραματικά πρωτόκολλα για τη μελέτη αυτή εγκρίθηκαν από το Συμβούλιο Επιστημονικής Δεοντολογίας του Ινστιτούτου Δημόσιας Υγείας της Αιθιοπίας. Ο αριθμός αναφοράς για την άδεια δεοντολογίας EPHI είναι EPHI/IRB-279-2020. Όλες οι μέθοδοι εφαρμόστηκαν σύμφωνα με τις συστάσεις και τις διατάξεις των εθνικών ολοκληρωμένων κατευθυντήριων γραμμών της Αιθιοπίας για τη θεραπεία της COVID-19. Επιπλέον, λήφθηκε γραπτή συναίνεση από όλους τους συμμετέχοντες στη μελέτη πριν από τη συμμετοχή στη μελέτη.
Όλα τα δεδομένα που λαμβάνονται ή αναλύθηκαν σε αυτή τη μελέτη περιλαμβάνονται σε αυτό το δημοσιευμένο άρθρο. Τα δεδομένα που υποστηρίζουν τα αποτελέσματα αυτής της μελέτης είναι διαθέσιμα από τον αντίστοιχο συγγραφέα κατόπιν εύλογου αιτήματος.
Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας. Συστάσεις για τις στρατηγικές εργαστηριακών δοκιμών για το COVID-19: Προσωρινή καθοδήγηση, 21 Μαρτίου 2020 Αρ. ΠΟΥ/2019-NCOV/LAB_TESTING/2020.1 (WHO, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki Covid-19 Smart Diagnosis στο τμήμα έκτακτης ανάγκης: all-in στην πράξη. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki Covid-19 Smart Diagnosis στο τμήμα έκτακτης ανάγκης: all-in στην πράξη.Muliou, DS, Pantazopoulos, Ι. Και Gurgulianis, Ki Intelligent Diagnosis of Covid-19 στο τμήμα έκτακτης ανάγκης: όλα στην πράξη.Muliou DS, Pantazopoulos Ι. Και Gurgulyanis KI Ευφυής διάγνωση του Covid-19 σε τμήματα έκτακτης ανάγκης: ολοκλήρωση από άκρο σε άκρο στην πράξη. Εμπειρογνώμονας Αιδεσιμότατος. φάρμακο. 3, 263-272 (2022).
Mitchell, SL & St George, Κ. Αξιολόγηση του Covid19 ID Now EUA. Mitchell, SL & St George, Κ. Αξιολόγηση του Covid19 ID Now EUA.Mitchell, SL και St. George, Κ. Αξιολόγηση του προσδιορισμού EUA Covid19 ID.Mitchell SL και St. George K. Αξιολόγηση του Covid19 ID Now EUA. J. Κλινική. Ιός. 128, 104429. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
ΠΟΥ. Εργαστηριακή ανίχνευση της νόσου του κοροναϊού 2019 (COVID-19) σε υποψία ανθρώπινης νόσου. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (πρόσβαση στις 15 Αυγούστου 2020) (ΠΟΥ, 2020).
Udugama, Β. Et αϊ. Διάγνωση Covid-19: Ασθένειες και εργαλεία δοκιμής. ACS Nano 14 (4), 3822-3835 (2020).
Syed S. et αϊ. Καθιέρωση του Κολλεγίου Παθολόγων της Ανατολικής, Κεντρικής και Νότιας Αφρικής - Περιφερειακή Σχολή Παθολογίας της Μέσης Ανατολής και της Νότιας Αφρικής. Αφρική. J. Lab. φάρμακο. 9 (1), 1-8 (2020).
Ινστιτούτο Δημόσιας Υγείας του Αιθιοπικού, Ομοσπονδιακό Υπουργείο Υγείας. Ενδιάμεση εθνική στρατηγική και καθοδήγηση για την εργαστηριακή διάγνωση του COVID-19. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/ephi_pheoc_covid-19_laboratory_diagnosis_eng.pdf (πρόσβαση στις 12 Αυγούστου 2020) (Ephi, 2020).
Woloshin, S., Patel, Ν. & Kesselheim, ως ψευδείς αρνητικές δοκιμές για τις προκλήσεις και τις συνέπειες της SARS-COV-2. Woloshin, S., Patel, Ν. & Kesselheim, ως ψευδείς αρνητικές δοκιμές για τις προκλήσεις και τις συνέπειες της SARS-COV-2.Voloshin S., Patel Ν. Και Kesselheim ως ψευδώς αρνητικές δοκιμές για λοιμώξεις SARS-COV-2 και τις συνέπειές τους.Voloshin S., Patel Ν. Και Kesselheim ως ψευδώς αρνητικές δοκιμές για την πρόκληση και την επίδραση της λοίμωξης από SARS-COV-2. Ν. Eng. J. Medicine. 383 (6), Ε38 (2020).
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI ψευδώς θετικές και ψευδώς αρνητικές περιπτώσεις Covid-19: στρατηγικές πρόληψης και διαχείρισης αναπνευστικής πρόληψης, εμβολιασμού και περαιτέρω προοπτικών. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI ψευδώς θετικές και ψευδώς αρνητικές περιπτώσεις Covid-19: στρατηγικές πρόληψης και διαχείρισης αναπνευστικής πρόληψης, εμβολιασμού και περαιτέρω προοπτικών. Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki ложнопожожаталные и лржнотататаοδο пичыеяые ыеяыеρακ, Covid-19: вцинацλί и далейшайшейшейшерерсеéΚεχα. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI ψευδώς θετικά και ψευδή αρνητικά περιπτώσεις COVID-19: στρατηγικές πρόληψης και θεραπείας αναπνευστικής πρόληψης, εμβολιασμού και προώθησης.Muliu, DS και Gurgulianis, KI ψευδώς θετικές και ψευδώς αρνητικές περιπτώσεις Covid-19: Στρατηγικές για την πρόληψη και τη θεραπεία της αναπνευστικής πρόληψης, τον εμβολιασμό και την πορεία προς τα εμπρός. Εμπειρογνώμονας Αιδεσιμότατος. φάρμακο. 15 (8), 993-1002 (2021).
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Covid-19 Διάγνωση στο τμήμα έκτακτης ανάγκης: Βλέποντας το δέντρο αλλά χάνοντας το δάσος. Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Covid-19 Διάγνωση στο τμήμα έκτακτης ανάγκης: Βλέποντας το δέντρο αλλά χάνοντας το δάσος.Mouliou, DS, Ioannis, P. και Konstantinos, G. Covid-19 Διάγνωση στο τμήμα έκτακτης ανάγκης: δείτε το δέντρο, χάνουν το δάσος.Muliou DS, Ioannis P., και Konstantinos G. Covid-19 Διάγνωση σε αίθουσες έκτακτης ανάγκης: Δεν είναι αρκετό δάσος για τα δέντρα. Εμφανίζομαι. φάρμακο. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-Angeli, Ε. Et αϊ. Επικύρωση και επικύρωση της αναλυτικής και κλινικής απόδοσης της δοκιμασίας SARS-COV-2 Abbott Realtime. J. Κλινική. Ιός. 129, 104474. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, ΑΑ, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, Μ. & Aflatoonian, Β. Σύγκριση πέντε συνόλων εκκινητών από διαφορετική περιοχή γονιδιώματος του Covid-19 για ανίχνευση μόλυνσης από ιό με συμβατική RT-PCR. Mollaei, HR, Afshar, ΑΑ, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, Μ. & Aflatoonian, Β. Σύγκριση πέντε συνόλων εκκινητών από διαφορετικές περιοχές γονιδιώματος του Covid-19 για ανίχνευση μόλυνσης από ιό με συμβατική RT-PCR.Mollaei, HR, Afshar, ΑΑ, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, Μ. Και Aflatunyan, Β. Σύγκριση πέντε συνόλων εκκινητών από διαφορετικές περιοχές του γονιδιώματος Covid-19 για την ανίχνευση ιικού λοίμωξη με συμβατική RT-PCR. Mollaei, HR, Afshar, ΑΑ, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, Μ. & Aflatoonian, Β. 比较来自 Covid-19 不同基因组区域的五个引物组, 用于通过常规 rt-PCR 检测病毒感染。 Mollaei, HR, Afshar, ΑΑ, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, Μ. & Aflatoonian, Β. Σύγκριση 5 διαφορετικών γενετικών περιοχών του Covid-19 για ανίχνευση ιογενούς λοίμωξης με συμβατική RT-PCR.Mollaei HR, Afshar ΑΑ, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour Μ. Και Aflatunyan Β. Σύγκριση πέντε συνόλων εκκινητών από διαφορετικές περιοχές του γονιδιώματος Covid-19 για ανίχνευση ιογενούς μόλυνσης από συμβατική RT-PCR.Ιράν. J. Microbiology. 12 (3), 185 (2020).
Goertzer, Ι. Et αϊ. Προκαταρκτικά αποτελέσματα του εθνικού προγράμματος αξιολόγησης εξωτερικής ποιότητας για την ανίχνευση αλληλουχιών γονιδιώματος SARS-COV-2. J. Κλινική. Ιός. 129, 104537. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
Wang, Μ. Et αϊ. Αναλυτική αξιολόγηση της αποτελεσματικότητας των πέντε κιτ RT-PCR για σοβαρό οξεία αναπνευστικό σύνδρομο Coronavirus 2, J. Clinical. εργαστήριο. πρωκτός. 35 (1), Ε23643 (2021).
Wang Β. Et αϊ. Αξιολόγηση επτά εμπορικά διαθέσιμων κιτ ανίχνευσης RNA SARS-COV-2 στην Κίνα με βάση την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης σε πραγματικό χρόνο (PCR). κλινικός. Χημική ουσία. εργαστήριο. φάρμακο. 58 (9), Ε149 -Ε153 (2020).
Van Casteren, PB et αϊ. Σύγκριση επτά εμπορικών διαγνωστικών κιτ RT-PCR Covid-19. J. Κλινική. Ιός. 128, 104412 (2020).
Lu, Yu, et αϊ. Σύγκριση της διαγνωστικής απόδοσης δύο κιτ PCR για την ανίχνευση νουκλεϊνικών οξέων SARS-COV-2. J. Κλινική. εργαστήριο. πρωκτός. 34 (10), Ε23554 (2020).
Lefart, PR, κλπ. Μια συγκριτική μελέτη τεσσάρων πλατφορμών δοκιμών ενίσχυσης νουκλεϊκού οξέος SARS-COV-2 (NAAT) έδειξε ότι η απόδοση ID τώρα αποικοδομήθηκε σημαντικά ανάλογα με τον ασθενή και τον τύπο του δείγματος. διάγνωση. μικροβιολογία. Μολύνω. diss. 99 (1), 115200 (2021).
Μόριο Abbott. Abbott σε πραγματικό χρόνο SARS-COV-2 Ανάλυση πακέτου. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/realtime-sars-cov-2-assay. 1-12. (Από τις 10 Αυγούστου 2020) (2020).
Klein, S. et αϊ. Η απομόνωση RNA SARS-COV-2 χρησιμοποιώντας μαγνητικά σφαιρίδια για ταχεία ανίχνευση μεγάλης κλίμακας με RT-qPCR και LAMP RT. Ο ιός 12 (8), 863 (2020).