Εκτέλεση τεσσάρων αναλύσεων ενίσχυσης νουκλεϊκού οξέος για τον εντοπισμό του SARS-CoV-2 στην Αιθιοπία

Σας ευχαριστούμε που επισκεφτήκατε το Nature.com.Χρησιμοποιείτε μια έκδοση προγράμματος περιήγησης με περιορισμένη υποστήριξη CSS.Για την καλύτερη εμπειρία, συνιστούμε να χρησιμοποιήσετε ένα ενημερωμένο πρόγραμμα περιήγησης (ή να απενεργοποιήσετε τη λειτουργία συμβατότητας στον Internet Explorer).Επιπλέον, για να διασφαλίσουμε τη συνεχή υποστήριξη, εμφανίζουμε τον ιστότοπο χωρίς στυλ και JavaScript.
Εμφανίζει ένα καρουζέλ τριών διαφανειών ταυτόχρονα.Χρησιμοποιήστε τα κουμπιά Προηγούμενο και Επόμενο για να μετακινηθείτε σε τρεις διαφάνειες κάθε φορά ή χρησιμοποιήστε τα κουμπιά ρυθμιστικού στο τέλος για να μετακινηθείτε σε τρεις διαφάνειες κάθε φορά.
Από το ξέσπασμα της νόσου του κοροναϊού (COVID-19) το 2019, πολλές εμπορικές δοκιμές ενίσχυσης νουκλεϊκών οξέων (NAAT) έχουν αναπτυχθεί σε όλο τον κόσμο και έχουν γίνει τυπικές δοκιμασίες.Αν και πολλές δοκιμές αναπτύχθηκαν γρήγορα και εφαρμόστηκαν σε εργαστηριακές διαγνωστικές δοκιμές, η απόδοση αυτών των δοκιμών δεν έχει αξιολογηθεί σε ποικίλες ρυθμίσεις.Ως εκ τούτου, αυτή η μελέτη είχε στόχο να αξιολογήσει την απόδοση των αναλύσεων Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI και Sansure Biotech χρησιμοποιώντας το Composite Reference Standard (CRS).Η μελέτη διεξήχθη στο Ινστιτούτο Δημόσιας Υγείας της Αιθιοπίας (EPHI) από 1 έως 30 Δεκεμβρίου 2020. Εξήχθησαν 164 ρινοφαρυγγικά δείγματα χρησιμοποιώντας το μίνι κιτ QIAamp RNA και το σύστημα προετοιμασίας δειγμάτων DNA Abbott.Από 164 δείγματα, το 59,1% ήταν θετικά και το 40,9% ήταν αρνητικά για CRS. Η θετικότητα του Sansure Biotech ήταν σημαντικά χαμηλή σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05). Η θετικότητα του Sansure Biotech ήταν σημαντικά χαμηλή σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05). Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению со CRS (p < 0,05). Τα θετικά αποτελέσματα της Sansure Biotech ήταν σημαντικά χαμηλότερα σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05).与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p < 0,05）。与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p < 0,05）。 У Sansure Biotech было значительно помалку положильных результатов по сравнению со CRS (p < 0,05). Η Sansure Biotech είχε σημαντικά λιγότερα θετικά αποτελέσματα σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05).Η συνολική συμφωνία των τεσσάρων αναλύσεων ήταν 96,3–100% σε σύγκριση με το CRS.Εκτός από το χαμηλό ποσοστό θετικότητας της ανάλυσης Sansure Biotech, η απόδοση των τεσσάρων αναλύσεων ήταν σχεδόν συγκρίσιμη.Ως εκ τούτου, η ανάλυση Sansure Biotech [Research Only (RUO)] απαιτεί πρόσθετη επικύρωση για τη χρήση της στην Αιθιοπία.Τέλος, θα πρέπει να εξεταστεί το ενδεχόμενο πρόσθετης έρευνας για την αξιολόγηση των αναλύσεων με τους κατάλληλους ισχυρισμούς του κατασκευαστή.
Οι εργαστηριακές δοκιμές αποτελούν μέρος του Στρατηγικού Σχεδίου του Παγκόσμιου Οργανισμού Υγείας (ΠΟΥ) για τη νόσο του κορωνοϊού 2019 (COVID-19) Ετοιμότητα και Αντίδραση (SPRP).Ο ΠΟΥ συμβουλεύει ότι οι χώρες πρέπει να οικοδομήσουν εργαστηριακές ικανότητες για να βελτιώσουν την ετοιμότητα, τη σωστή διαχείριση περιπτώσεων, την επαγρύπνηση και την ταχεία ανταπόκριση στις προκλήσεις της δημόσιας υγείας.Αυτό υποδηλώνει ότι ο ρόλος του εργαστηρίου είναι βασικός για τον χαρακτηρισμό της νόσου και της επιδημιολογίας των αναδυόμενων μολυσματικών παραγόντων και τον έλεγχο της εξάπλωσής τους.
Η διάγνωση του COVID-19 απαιτεί επιδημιολογικές και ιατρικές πληροφορίες, προσωπικά συμπτώματα/σημεία και ακτινογραφικά και εργαστηριακά δεδομένα2.Από τότε που αναφέρθηκε το ξέσπασμα του COVID-19 στο Wuhan της Κίνας, έχουν αναπτυχθεί πολλές εμπορικές δοκιμές ενίσχυσης νουκλεϊκών οξέων (NAAT) σε όλο τον κόσμο.Η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης αντίστροφης μεταγραφής σε πραγματικό χρόνο (rRT-PCR) έχει χρησιμοποιηθεί ως συνήθης και τυπική μέθοδος για την εργαστηριακή διάγνωση της σοβαρής λοίμωξης από οξύ αναπνευστικό σύνδρομο 2 (SARS-CoV-2)3.Η μοριακή ανίχνευση του SARS-CoV-2 βασίζεται τυπικά στα γονίδια N (γονίδιο πρωτεΐνης νουκλεοκαψιδίου), E (γονίδιο πρωτεΐνης φακέλου) και RdRp (εξαρτώμενο από RNA γονίδιο RNA πολυμεράσης) στο ORF1a/b (ανοιχτό πλαίσιο ανάγνωσης 1a/b) .γονίδιο) περιοχή που ταυτοποιήθηκε από το γονιδίωμα του ιού.Θεωρούνται ότι είναι οι κύριες διατηρημένες περιοχές που βρίσκονται στα ιικά γονιδιώματα για την αναγνώριση ιών4.Μεταξύ αυτών των γονιδίων, τα γονίδια RdRp και E έχουν υψηλή ευαισθησία αναλυτικής ανίχνευσης, ενώ το γονίδιο N έχει χαμηλή αναλυτική ευαισθησία5.
Η απόδοση των αναλύσεων PCR μπορεί να ποικίλλει ανάλογα με διάφορους παράγοντες όπως: αντιδραστήρια εκχύλισης, αντιδραστήρια ενίσχυσης/ανίχνευσης, μέθοδος εκχύλισης, ποιότητα της μηχανής PCR και άλλα όργανα.Από τον Απρίλιο του 2020, περισσότερες από 48 διαφορετικές διαγνωστικές συσκευές από εννέα χώρες έλαβαν Άδεια Χρήσης Έκτακτης Ανάγκης (EUA) για διαγνωστικά COVID-196.Στην Αιθιοπία, περισσότερες από 14 πλατφόρμες PCR σε πραγματικό χρόνο χρησιμοποιούνται για την ανίχνευση PCR του SARS-CoV-2 σε 26 δημόσια ιδρύματα υγείας, συμπεριλαμβανομένων των ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 και Quant-studio7.Επιπλέον, είναι διαθέσιμα διάφορα κιτ δοκιμών PCR, όπως η δοκιμή Daan Gene, η δοκιμή Abbott SARS-CoV-2, η δοκιμή Sansure Biotech και η δοκιμή SARS-CoV-2 BGI.Αν και η rRT-PCR είναι εξαιρετικά ευαίσθητη, ορισμένοι ασθενείς με COVID-19 αναφέρουν ψευδώς αρνητικά αποτελέσματα λόγω ανεπαρκών αντιγράφων ιικού ριβονουκλεϊκού οξέος (RNA) σε δείγματα λόγω ακατάλληλης συλλογής, μεταφοράς, αποθήκευσης και χειρισμού και εργαστηριακών εξετάσεων.συνθήκες και ενέργειες του προσωπικού8.Επιπλέον, ο λάθος χειρισμός του δείγματος ή ο έλεγχος, η ρύθμιση του ορίου κύκλου (Ct) και η διασταυρούμενη αντιδραστικότητα με άλλα παθογόνα νουκλεϊκά οξέα ή ανενεργό/υπολειπόμενο RNA SARS-CoV-2 μπορεί να οδηγήσει σε ψευδώς θετικά αποτελέσματα σε προσδιορισμούς rRT-PCR9.Έτσι, είναι σαφές ότι οι δοκιμές PCR μπορούν πράγματι να αναγνωρίσουν φορείς γονιδιακών θραυσμάτων, καθώς δεν μπορούν καν να διακρίνουν μεταξύ πραγματικά ενεργών ιικών γονιδίων, επομένως οι δοκιμές μπορούν να αναγνωρίσουν μόνο φορείς και όχι ασθενείς10.Ως εκ τούτου, είναι σημαντικό να αξιολογήσουμε τη διαγνωστική απόδοση χρησιμοποιώντας τυπικές μεθόδους στο περιβάλλον μας.Αν και πολλά αντιδραστήρια NAAT είναι διαθέσιμα στο Ινστιτούτο Δημόσιας Υγείας της Αιθιοπίας (EPHI) και σε ολόκληρη τη χώρα, δεν έχει ακόμη αναφερθεί συγκριτική αξιολόγηση της αποτελεσματικότητάς τους.Ως εκ τούτου, αυτή η μελέτη είχε ως στόχο να αξιολογήσει τη συγκριτική απόδοση των εμπορικά διαθέσιμων κιτ για την ανίχνευση του SARS-CoV-2 με rRT-PCR χρησιμοποιώντας κλινικά δείγματα.
Συνολικά 164 συμμετέχοντες με ύποπτο COVID-19 συμπεριλήφθηκαν σε αυτή τη μελέτη.Η πλειοψηφία των δειγμάτων ήταν από κέντρα θεραπείας (118/164 = 72%), ενώ οι υπόλοιποι 46 (28%) συμμετέχοντες ήταν από κέντρα μη θεραπείας.Μεταξύ των συμμετεχόντων που δεν υποβλήθηκαν σε θεραπεία στο κέντρο, 15 (9,1%) είχαν κλινικά ύποπτα κρούσματα και 31 (18,9%) είχαν επαφές με επιβεβαιωμένα κρούσματα.Ενενήντα τρεις (56,7%) συμμετέχοντες ήταν άνδρες και η μέση (± SD) ηλικία των συμμετεχόντων ήταν 31,10 (± 11,82) έτη.
Σε αυτή τη μελέτη, προσδιορίστηκαν θετικά και αρνητικά ποσοστά τεσσάρων τεστ για COVID-19.Έτσι, τα θετικά ποσοστά του προσδιορισμού Abbott SARS-CoV-2, του προσδιορισμού Daan Gene 2019-nCoV, του προσδιορισμού SARS-CoV-2 BGI και του Sansure Biotech 2019-nCoV ήταν 59,1%, 58,5%, 57,9% και 55 αντίστοιχα. .Η θετική και η αρνητική βαθμολογία σύνθετου προτύπου αναφοράς (CRS) ήταν 97 (59,1%) και 67 (40,9%), αντίστοιχα (Πίνακας 1).Σε αυτή τη μελέτη, ο ορισμός του CRS βασίστηκε στον κανόνα «οποιοδήποτε θετικό», σύμφωνα με τον οποίο από τέσσερα αποτελέσματα δοκιμών, δύο ή περισσότερα αποτελέσματα δοκιμών που έδωσαν το ίδιο αποτέλεσμα θεωρήθηκαν αληθινά θετικά ή αρνητικά.
Σε αυτή τη μελέτη, βρήκαμε μια αρνητική ποσοστιαία συμφωνία (NPA) 100% (95% CI 94,6–100) για όλες τις αναλύσεις σε σύγκριση με το CRS.Η ανάλυση Sansure Biotechnology έδειξε ελάχιστο PPA 93,8% (95% CI 87,2-97,1) και η ανάλυση Daan Gene 2019-nCoV είχε συνολική συμφωνία 99,4% (95% CI 96,6-99,9).Αντίθετα, η συνολική συμφωνία μεταξύ της ανάλυσης SARS-CoV-2 BGI και της ανάλυσης Sansure Biotech 2019-nCoV ήταν 98,8% και 96,3% αντίστοιχα (Πίνακας 2).
Ο συντελεστής συμφωνίας κάπα του Cohen μεταξύ των αποτελεσμάτων της ανάλυσης CRS και Abbott SARS-CoV-2 ήταν πλήρως συνεπής (K = 1,00).Ομοίως, οι τιμές κάππα του Cohen που ανιχνεύθηκαν από τα Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI και Sansure Biotech 2019-nCoV είναι επίσης πλήρως συνεπείς με το CRS (K ≥ 0,925).Σε αυτήν τη συγκριτική ανάλυση, το τεστ chi-square (δοκιμή McNemar) έδειξε ότι τα αποτελέσματα του προσδιορισμού Sansure Biotech 2019-nCoV ήταν σημαντικά διαφορετικά από τα αποτελέσματα του CRS (p = 0,031) (Πίνακας 2).
Όπως φαίνεται στο Σχ.1 το ποσοστό της χαμηλότερης τιμής Ct (< 20 Ct) της ανάλυσης Abbott SARS-CoV-2 (συνδυασμένο γονίδιο RdRp και N) ήταν 87,6% και η τιμή Ct του γονιδίου ORF1a/b της ανάλυσης Sansure Biotech 2019-nCoV έδειξε ότι το ποσοστό των χαμηλών Η τιμή Ct (< 20 Ct) ήταν 50,3% και η υψηλή τιμή Ct (36–40 Ct) ήταν 3,2%. 1 το ποσοστό της χαμηλότερης τιμής Ct (< 20 Ct) της ανάλυσης Abbott SARS-CoV-2 (συνδυασμένο γονίδιο RdRp και N) ήταν 87,6% και η τιμή Ct του γονιδίου ORF1a/b της ανάλυσης Sansure Biotech 2019-nCoV έδειξε ότι το ποσοστό των χαμηλών Η τιμή Ct (< 20 Ct) ήταν 50,3% και η υψηλή τιμή Ct (36–40 Ct) ήταν 3,2%.Όπως φαίνεται στο Σχ.1, ποσοστό της τιμής Ct (< 20 Ct) ανάλυση Abbott SARS-CoV-2 (συνδυασμός γέννησης RdRp και N) αποτελείτο 87,6%, μια σημασία Ct στην ORF1a/b ανάλυση Sansure Biotech 2019-nCoV (< 20 Ct) συνιστά 50,3%, а высокое значение Ct (36–40 Ct) αποτελεί 3,2%. 1, το ποσοστό της ανάλυσης χαμηλότερης τιμής Ct (< 20 Ct) του Abbott SARS-CoV-2 (συνδυασμένο γονίδιο RdRp και N) ήταν 87,6% και η τιμή Ct της ανάλυσης γονιδίου ORF1a/b του Sansure Biotech 2019-nCoV έδειξε ότι το ποσοστό χαμηλής τιμής Ct (< 20 Ct) αντιπροσώπευε το 50,3%, και υψηλής τιμής Ct (36–40 Ct) αντιπροσώπευε το 3,2%.如图1 所示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20 Ct）为87.6%，Sansure Biotech 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct值(< 20 Ct) 的百分比为50,3%，高Ct 值(36–40 Ct) 的百分比为3,2%。 Όπως φαίνεται στο Σχήμα 1, το χαμηλότερο ποσοστό τιμής Ct (< 20 Ct) της δοκιμής Abbott SARS-CoV-2 (συνδυασμός γονιδίου RdRp και N) είναι 87,6%, η τιμή Ct του γονιδίου ORF1a/b της δοκιμής Sansure Biotech 2019-nCoV δείχνει χαμηλό Ct值(< 20 Ct) 的 ποσοστό είναι 50,3%, 高Ct 值(36–40 Ct) 的 το ποσοστό είναι 3,2%. Ως γνωστόν στο рисунке 1, αναλύει το Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) ονομάστηκε μόνο μικρότερη σημασία Ct (< 20 Ct) σε ποσοστό 87,6%, με σημείωση Ct гена ORF1a/b technoe 2010 - Анализ nCoV показал низкий Ct. Όπως φαίνεται στο Σχήμα 1, ο προσδιορισμός Abbott SARS-CoV-2 (συνδυάζοντας τα γονίδια RdRp και N) είχε τη χαμηλότερη ποσοστιαία τιμή Ct (< 20 Ct) στο 87,6%, ενώ η τιμή Ct του γονιδίου ORF1a/b στο Sansure Μελέτη Biotech 2019 – Η ανάλυση του nCoV έδειξε χαμηλό Ct. Το ποσοστό της τιμής Ct (< 20 Ct) ήταν 50,3%, το ποσοστό της τιμής Ct (36–40 Ct) ήταν 3,2%. Το ποσοστό των τιμών (< 20 Ct) ήταν 50,3%, και το ποσοστό των υψηλών τιμών Ct (36–40 Ct) ήταν 3,2%.Το τεστ Abbott SARS-CoV-2 B κατέγραψε τιμές Ct πάνω από 30. Από την άλλη πλευρά, στον προσδιορισμό BGI SARS-CoV-2 το γονίδιο ORF1a/b είχε υψηλή τιμή Ct (> 36 Ct) το ποσοστό ήταν 4% (Εικ. 1). Από την άλλη πλευρά, στον προσδιορισμό BGI SARS-CoV-2 το γονίδιο ORF1a/b είχε υψηλή τιμή Ct (> 36 Ct) το ποσοστό ήταν 4% (Εικ. 1). Во другото стороны, στην ανάλυση του BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b ονομαστική τιμή Ct (> 36 Ct), ποσοστό που αντιστοιχεί σε 4% (ρίσ. 1). Από την άλλη, στην ανάλυση του γονιδίου BGI SARS-CoV-2 ORF1a/b είχε υψηλή τιμή Ct (> 36 Ct), το ποσοστό της οποίας ήταν 4% (Εικ. 1).另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比中 Από την άλλη πλευρά, στην ανίχνευση BGI SARS-CoV-2, το ποσοστό του γονιδίου ORF1a/b με υψηλή τιμή Ct (>36 Ct) είναι 4% (Εικόνα 1). Во другото стороны, στην ανάλυση του BGI SARS-CoV-2, το ποσοστό του ORF1a/b με την αξία του Ct (>36 Ct) είναι 4% (ρίς 1). Από την άλλη πλευρά, στην ανάλυση BGI SARS-CoV-2, το ποσοστό των γονιδίων ORF1a/b με υψηλές τιμές Ct (>36 Ct) ήταν 4% (Εικ. 1).
Σε αυτή τη μελέτη, λάβαμε 164 ρινοφαρυγγικά δείγματα.Για όλους τους τύπους αναλύσεων, η απομόνωση και η ενίσχυση RNA πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας τις μεθόδους και τα κιτ που συνιστώνται από τους αντίστοιχους κατασκευαστές.
Αυτή η μελέτη έδειξε ότι το τεστ του Abbott για SARS-CoV-2 έχει την ίδια απόδοση ανίχνευσης με το CRS, με 100% θετική, αρνητική και συνολική συμφωνία.Η συμφωνία κάπα του Cohen είναι 1,00, υποδεικνύοντας την πλήρη συμφωνία με το CRS.Μια παρόμοια μελέτη από το Πανεπιστήμιο της Ουάσιγκτον στις ΗΠΑ διαπίστωσε ότι η συνολική ευαισθησία και ειδικότητα του τεστ Abbott για SARS-CoV-2 ήταν 93% και 100%, αντίστοιχα, σε σύγκριση με την εργαστηριακά καθορισμένη δοκιμασία (LDA) του CDC .11. Το σύστημα ανίχνευσης Abbott SARS-CoV-2 βασίζεται στην ταυτόχρονη συνδυασμένη ανίχνευση των γονιδίων N και RdRp, καθώς και τα δύο γονίδια είναι πιο ευαίσθητα, ελαχιστοποιώντας τα ψευδώς αρνητικά12.Μια μελέτη στη Βιέννη της Αυστρίας έδειξε επίσης ότι οι μεγάλοι όγκοι δειγμάτων εκχύλισης και οι όγκοι εκλούσματος ανίχνευσης ελαχιστοποιούσαν τα αποτελέσματα αραίωσης και αύξησαν την αποτελεσματικότητα ανίχνευσης13.Έτσι, το τέλειο ταίρι της Abbott για τον προσδιορισμό SARS-CoV-2 μπορεί να συσχετιστεί με ένα σύστημα ανίχνευσης πλατφόρμας που εντοπίζει ταυτόχρονα συνδυαστικά γονίδια, εξάγει μεγάλο αριθμό δειγμάτων (0,5 ml) και χρησιμοποιεί μεγάλη ποσότητα διαλύτη έκλουσης (40 μl).
Τα αποτελέσματά μας έδειξαν επίσης ότι η απόδοση ανίχνευσης του γενετικού τεστ Daan ήταν σχεδόν ίδια με εκείνη του CRS.Αυτό συμφωνεί με μια μελέτη14 που διεξήχθη στο Πανεπιστήμιο Anhui στο Huainan της Κίνας και τον ισχυρισμό του κατασκευαστή για 100% θετική συμφωνία.Παρά τις αναφορές για σταθερά αποτελέσματα, ένα δείγμα ήταν ψευδώς αρνητικό μετά από επανέλεγχο του ίδιου εκλούσματος, αλλά ήταν θετικό στις αναλύσεις Abbott SARS-CoV-2 και Sansure Biotech nCoV-2019.Αυτό υποδηλώνει ότι μπορεί να υπάρχει μεταβλητότητα στα αποτελέσματα σε διαφορετικούς τύπους δοκιμασιών. Ωστόσο, στη μελέτη που διεξήχθη στην Κίνα15, το αποτέλεσμα της ανάλυσης γονιδίου Daan ήταν σημαντικά διαφορετικό (p < 0,05) σε σύγκριση με τη δοκιμασία αναφοράς που ορίστηκε στο εργαστήριο. Ωστόσο, στη μελέτη που διεξήχθη στην Κίνα15, το αποτέλεσμα της ανάλυσης γονιδίου Daan ήταν σημαντικά διαφορετικό (p < 0,05) σε σύγκριση με τη δοκιμασία αναφοράς που ορίστηκε στο εργαστήριο. Тем не мие, в исследовании, проведенном во Китае15, αποτέλεσμα ανάλυσης Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) από их лабораторного эталонного ανάλυση. Ωστόσο, σε μια μελέτη στην Κίνα15, το αποτέλεσμα της ανάλυσης του Daan Gene ήταν σημαντικά διαφορετικό (p < 0,05) από την εργαστηριακή ανάλυση αναφοράς.然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义基因检测的结果与其实验室定义的定义基因检测的结果与其实验室定义的市然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义基因检测的结果与其实验室定义的定义基因检测的结果与其实验室定义的定义基因检测的结果与其实验室定义的定义基因的研究中15. Однако в исследовании, проведенном во Китае15, результаты генетски теста Daan значительно отличались (p < 0,05) по сравнению со его эталонным лабораторным тестом. Ωστόσο, σε μια μελέτη στην Κίνα15, τα αποτελέσματα του γενετικού τεστ του Daan ήταν σημαντικά διαφορετικά (p < 0,05) σε σύγκριση με το εργαστηριακό τεστ αναφοράς του.Αυτή η απόκλιση μπορεί να οφείλεται στην ευαισθησία του τεστ αναφοράς για την ανίχνευση του SARS-CoV-2 και περαιτέρω μελέτες μπορεί να είναι σημαντικές για τον προσδιορισμό της αιτίας.
Επιπλέον, η μελέτη μας αξιολόγησε τη συγκριτική απόδοση της ανάλυσης SARS-CoV-2 BGI με CRS, δείχνοντας εξαιρετική θετική ποσοστιαία συμφωνία (PPA = 97,9%), αρνητική ποσοστιαία συμφωνία (NPA = 100%) και συνολική ποσοστιαία συμφωνία ανά φύλο ( ΟΠΑ).).= 98,8%).Οι τιμές Κάπα του Cohen έδειξαν καλή συμφωνία (K = 0,975).Μελέτες στην Ολλανδία16 και στην Κίνα15 έχουν δείξει σταθερά αποτελέσματα.Η δοκιμή SARS-CoV-2 BGI είναι μια δοκιμή ανίχνευσης ενός γονιδίου (ORF1a/b) που χρησιμοποιεί 10 μl έκλουσης ενίσχυσης/ανίχνευσης.Παρά την καλή στατιστική συμφωνία με τα αποτελέσματα αναφοράς μας, η ανάλυση έχασε δύο θετικά δείγματα (1,22%) του συνολικού δείγματος.Αυτό μπορεί να έχει τεράστιες κλινικές επιπτώσεις για τη δυναμική μετάδοσης τόσο σε επίπεδο ασθενούς όσο και σε επίπεδο κοινότητας.
Μια άλλη συγκριτική ανάλυση που συμπεριλήφθηκε σε αυτή τη μελέτη ήταν η δοκιμασία Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO).το συνολικό ποσοστό αγώνα ήταν 96,3%.Η ισχύς της συμφωνίας καθορίστηκε επίσης από την τιμή Κάπα του Cohen, η οποία ήταν 0,925, υποδηλώνοντας πλήρη συμφωνία με το CRS.Και πάλι, τα αποτελέσματά μας είναι πανομοιότυπα με τις μελέτες που πραγματοποιήθηκαν στο Central South University στην Changsha της Κίνας και στο Clinical Laboratory Department του Liuzhou People's Hospital, Liuzhou City, Κίνα17. Παρόλο που καταγράφηκε η παραπάνω καλή στατιστική συμφωνία, η δοκιμή chi-square (δοκιμή MacNemar) έδειξε ότι το αποτέλεσμα της ανάλυσης Sansure Biotech είχε στατιστικά σημαντική διαφορά σε σύγκριση με το CRS (p < 0,005). Παρόλο που καταγράφηκε η παραπάνω καλή στατιστική συμφωνία, η δοκιμή chi-square (δοκιμή MacNemar) έδειξε ότι το αποτέλεσμα της ανάλυσης Sansure Biotech είχε στατιστικά σημαντική διαφορά σε σύγκριση με το CRS (p < 0,005). Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Манемара) показал, что результат ανάλυση Sansure Biotech ονομάζει στατιστικά με 0,00 C. Αν και καταγράφηκε η καλή στατιστική συμφωνία παραπάνω, η δοκιμή chi-square (δοκιμή McNemar) έδειξε ότι το αποτέλεσμα της ανάλυσης Sansure Biotech είχε στατιστικά σημαντική διαφορά σε σύγκριση με το CRS (p < 0,005).尽管 记录 了 上述 良好 的 统计 一致性 但 但 卡方 检验 检验 检验 检验 检验 检验 检验 检验 检验 的 的 结果 结果 与 ς尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 ， 但 检验 （（macnemar 检验 表明 ， ， sansure biotech 检测 结果 与 crs 相比 具有 显着 （（p <0.005。。。。。。。。。。。。。。。。 ………………………………………………………………………. Несмотря на отмеченное выше хорошее статистичко соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Манемара) показал статистически значимую ζωηρά (p < 0,005) меѓу αναλυτές Sansure Biotech και CRS. Παρά την καλή στατιστική συμφωνία που σημειώθηκε παραπάνω, η δοκιμή chi-square (δοκιμή McNemar) έδειξε μια στατιστικά σημαντική διαφορά (p < 0,005) μεταξύ της ανάλυσης Sansure Biotech και της CRS.Έξι δείγματα (3,66%) βρέθηκαν να είναι ψευδώς αρνητικά σε σύγκριση με το CRS (Συμπληρωματικός Πίνακας 1).αυτό είναι πολύ σημαντικό, ειδικά δεδομένης της δυναμικής μετάδοσης του ιού.Τα παραπάνω δεδομένα υποστηρίζουν επίσης αυτό το χαμηλό ποσοστό ανίχνευσης15.
Σε αυτή τη μελέτη, προσδιορίστηκαν οι τιμές Ct για κάθε προσδιορισμό και την αντίστοιχη πλατφόρμα, με τη χαμηλότερη μέση τιμή Ct που αναφέρεται στην ανάλυση Abbott SARS-CoV-2.Αυτό το αποτέλεσμα μπορεί να σχετίζεται με το σύστημα ταυτόχρονου συνδυασμένου γενετικού ελέγχου της Abbott για την ανίχνευση του SARS-CoV-2.Επομένως, σύμφωνα με το Σχήμα 1, το 87,6% των αποτελεσμάτων του Abbott SARS-CoV-2 είχαν τιμές Ct κάτω από 20. Μόνο ένας μικρός αριθμός αποτελεσμάτων δειγμάτων (12,4%) ήταν στην περιοχή 20-30.Οι τιμές Ct πάνω από 30 δεν καταγράφηκαν.Εκτός από τη χρήση της μορφής γενετικής δοκιμής του πάνελ SARS-CoV-2 από την Abbott, αυτό το αποτέλεσμα μπορεί να σχετίζεται με το κατώτερο όριο ανίχνευσης (32,5 αντίγραφα RNA/mL)18, το οποίο είναι τρεις φορές χαμηλότερο από το κατώτερο όριο των 100 αντιγράφων RNA της εταιρείας /mL.ml) 19.
Αυτή η μελέτη έχει ορισμένους περιορισμούς: πρώτον, δεν έχουμε τυπικές μεθόδους/μεθόδους αναφοράς [όπως ιικό φορτίο ή άλλες εργαστηριακές δοκιμές (LDA)] λόγω έλλειψης πόρων.Δεύτερον, όλα τα δείγματα που χρησιμοποιήθηκαν σε αυτή τη μελέτη ήταν ρινοφαρυγγικά επιχρίσματα, ενώ τα αποτελέσματα δεν ήταν εφαρμόσιμα σε άλλους τύπους δειγμάτων και τρίτον, το μέγεθος του δείγματός μας ήταν μικρό.
Αυτή η μελέτη συνέκρινε την απόδοση τεσσάρων αναλύσεων rRT-PCR για SARS-CoV-2 χρησιμοποιώντας ρινοφαρυγγικά δείγματα.Όλες οι δοκιμασίες ανίχνευσης είχαν σχεδόν συγκρίσιμες επιδόσεις, με εξαίρεση την ανάλυση Sansure Biotech. Επιπλέον, το χαμηλό ποσοστό θετικότητας εντοπίστηκε στην ανάλυση Sansure Biotech σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05). Επιπλέον, το χαμηλό ποσοστό θετικότητας εντοπίστηκε στην ανάλυση Sansure Biotech σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05). Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен ниско ниво потрошеност положительных результатов по сравнению со CRS (p < 0,05). Επιπλέον, το τεστ Sansure Biotech έδειξε χαμηλό ποσοστό θετικών αποτελεσμάτων σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05).此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0,05)。此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0,05)。 Кроме того, анализ Sansure Biotech όνομαл може да се спореди со CRS (p < 0,05). Επιπλέον, η ανάλυση Sansure Biotech είχε χαμηλότερο ποσοστό θετικότητας σε σύγκριση με το CRS (p < 0,05).Η ανάλυση Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) του PPA, του NPA και της συνολικής συμφωνίας ξεπέρασε το 93,5% με τιμή συμφωνίας Cohen Kappa 0,925.Τέλος, η Sansure Biotech Assay (RUO) χρειάζεται περαιτέρω επικύρωση για χρήση στην Αιθιοπία και θα πρέπει να εξεταστεί το ενδεχόμενο πρόσθετης έρευνας για την αξιολόγηση των ισχυρισμών από μεμονωμένους κατασκευαστές.
Ο συγκριτικός σχεδιασμός της μελέτης διεξήχθη σε τέσσερις εγκαταστάσεις υγείας στην Αντίς Αμπέμπα, το Νοσοκομείο Eka Kotebe, το Κέντρο Θεραπείας Εκκλησίας Millennium, το Νοσοκομείο Zewooditu Memorial και το Ειδικό Νοσοκομείο για τη Φυματίωση του Αγίου Πέτρου.Τα δεδομένα συλλέχθηκαν μεταξύ 1ης και 31ης Δεκεμβρίου 2020. Οι ιατρικές εγκαταστάσεις για αυτήν τη μελέτη επιλέχθηκαν σκόπιμα με βάση τον υψηλό αριθμό περιπτώσεων και τη διαθεσιμότητα των κύριων θεραπευτικών κέντρων στην πόλη.Ομοίως, όργανα, συμπεριλαμβανομένων των οργάνων PCR σε πραγματικό χρόνο ABI 7500 και Abbott m2000, επιλέχθηκαν σύμφωνα με τις συστάσεις των κατασκευαστών αντιδραστηρίων NAAT και τέσσερα κιτ ανίχνευσης PCR επιλέχθηκαν για αυτή τη μελέτη, καθώς τα περισσότερα εργαστήρια στην Αιθιοπία χρησιμοποιούσαν τουλάχιστον τουλάχιστον τέσσερις από αυτούς.Δοκιμή γονιδίου, δοκιμή Abbott SARS-CoV-2, δοκιμή Sansure Biotech και δοκιμή SARS-CoV-2 BGI που πραγματοποιήθηκε κατά τη διάρκεια της μελέτης).
Ο έλεγχος για SARS-CoV-2 πραγματοποιήθηκε από 1 έως 30 Δεκεμβρίου 2020 με χρήση 3 ml μέσου μεταφοράς ιών (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, Κίνα) από άτομα υπό έρευνα για COVID-19 που παραπέμπονται στο EPHI.Τα ρινοφαρυγγικά δείγματα συλλέχθηκαν από εκπαιδευμένους συλλέκτες δειγμάτων και στάλθηκαν στην EPHI σε τριπλές συσκευασίες.Πριν από την απομόνωση νουκλεϊκού οξέος, σε κάθε δείγμα εκχωρείται ένας μοναδικός αριθμός αναγνώρισης.Η εκχύλιση πραγματοποιείται από κάθε δείγμα αμέσως μετά την άφιξη χρησιμοποιώντας μεθόδους χειροκίνητης και αυτόματης εκχύλισης.Έτσι, για την αυτόματη εκχύλιση του Abbott m2000, 1,3 ml (συμπεριλαμβανομένου 0,8 ml νεκρού όγκου και 0,5 ml όγκου εισόδου εκχύλισης) του δείγματος εκχυλίστηκε από κάθε δείγμα και πέρασε μέσω του συστήματος παρασκευής δείγματος DNA Abbott (Abbott Molecular Inc. des Plaines, IL, ΗΠΑ).) Μια παρτίδα 96 [92 δείγματα, δύο έλεγχοι ανίχνευσης και δύο έλεγχοι χωρίς πρότυπο (NTC)] συμπεριλήφθηκε στη συνολική διαδικασία (ανάκτηση και ανίχνευση) δύο γύρων του SARS-CoV-2 (EUA) σε πραγματικό χρόνο.εξόρυξη.Ομοίως, για χειροκίνητη εξαγωγή, χρησιμοποιήστε τα ίδια δείγματα (για αυτόματη εξαγωγή και ανακάλυψη).Έτσι, καθ' όλη τη διάρκεια της διαδικασίας, δείγματα 140 μl κατανεμήθηκαν και εκχυλίστηκαν χρησιμοποιώντας το κιτ QIAamp Viral RNA Mini (QIAGEN GmbH, Hilden, Γερμανία) σε παρτίδες των 24 (συμπεριλαμβανομένων 20 δειγμάτων, δύο μάρτυρες προσδιορισμού και δύο NTC) σε εννέα γύρους.Τα εκλούσματα που εξήχθησαν με το χέρι ενισχύθηκαν και ανιχνεύθηκαν χρησιμοποιώντας έναν θερμικό κυκλοποιητή ABI 7500 χρησιμοποιώντας τη δοκιμασία SARS-CoV-2 BGI, τη δοκιμασία Daan Gene και τη δοκιμασία Sansure Biotech.
Η αυτοματοποιημένη απομόνωση και ο καθαρισμός του ιικού RNA του SARS-CoV-2 ακολουθεί την αρχή των μαγνητικών σφαιριδίων χρησιμοποιώντας αντιδραστήρια προετοιμασίας δειγμάτων DNA της Abbott.Η απενεργοποίηση των δειγμάτων και η διαλυτοποίηση των ιικών σωματιδίων πραγματοποιείται χρησιμοποιώντας ένα απορρυπαντικό που περιέχει ισοθειοκυανική γουανιδίνη για τη μετουσίωση της πρωτεΐνης και την απενεργοποίηση της RNase.Στη συνέχεια, το RNA διαχωρίζεται από την πρωτεΐνη με διαχωρισμό στερεάς φάσης χρησιμοποιώντας πυρίτιο, δηλαδή το άλας γουανιδινίου και το αλκαλικό pH του ρυθμιστικού διαλύματος λύσης προάγουν τη δέσμευση των νουκλεϊκών οξέων στο πυρίτιο (SiO2).Το βήμα έκπλυσης αφαιρεί τις εναπομείνασες πρωτεΐνες και τα υπολείμματα για να παραχθεί ένα διαυγές διάλυμα.Το διαφανές RNA απομονώνεται από μικροσωματίδια με βάση το πυρίτιο χρησιμοποιώντας το μαγνητικό πεδίο του οργάνου20,21.Από την άλλη πλευρά, η χειροκίνητη απομόνωση και ο καθαρισμός του RNA πραγματοποιείται με τη μέθοδο της στήλης spin χρησιμοποιώντας φυγοκέντρηση αντί για μαγνητική βάση και διαχωρισμό μικροσωματιδίων από το υγρό έκλουσης.
Το τεστ ανίχνευσης SARS-CoV-2 σε πραγματικό χρόνο Abbott (Abbott Molecular, Inc.) πραγματοποιήθηκε σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή, ο οποίος έλαβε EUA19,22 από τον ΠΟΥ και τον FDA.Σε αυτό το πρωτόκολλο, η απενεργοποίηση του δείγματος πριν από την εκχύλιση πραγματοποιήθηκε σε λουτρό νερού στους 56 °C για 30 λεπτά.Μετά την απενεργοποίηση του ιού, η εκχύλιση νουκλεϊκού οξέος πραγματοποιήθηκε σε ένα όργανο Abbott m2000 SP από 0,5 ml VTM χρησιμοποιώντας ένα σύστημα προετοιμασίας δείγματος DNA Abbott m2000.σύμφωνα με τον κατασκευαστή.Η ενίσχυση και η ανίχνευση πραγματοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας ένα όργανο Abbott m2000 RT-PCR και πραγματοποιήθηκε διπλή ανίχνευση για τα γονίδια RdRp και N.ROX) και VIC P (ιδιόκτητη βαφή) για στόχευση και ανίχνευση εσωτερικών ελέγχων, επιτρέποντας την ταυτόχρονη ανίχνευση και των δύο προϊόντων ενίσχυσης 19 .
Η μέθοδος ανίχνευσης ενίσχυσης αυτού του κιτ βασίζεται στην τεχνολογία RT-PCR ενός βήματος.Τα γονίδια ORF1a/b και Ν επιλέχθηκαν ως συντηρημένες περιοχές από την Daan Gene Technology για την ανίχνευση της ενίσχυσης της περιοχής στόχου.Ειδικοί εκκινητές και φθορίζοντες ανιχνευτές (ανιχνευτές γονιδίου Ν σημασμένοι με FAM, ανιχνευτές ORF1a/b σημασμένοι με VIC) έχουν σχεδιαστεί για την ανίχνευση RNA του SARS-CoV-2 σε δείγματα.Το τελικό μίγμα εκλούσεως και τα κύρια μίγματα παρασκευάστηκαν προσθέτοντας 5 μΐ διαλύματος έκλουσης σε 20 μΙ του κύριου μίγματος σε τελικό όγκο 25 μΙ.Η ενίσχυση και η ανίχνευση πραγματοποιήθηκαν ταυτόχρονα σε ένα όργανο PCR πραγματικού χρόνου ABI 750024.
Τα γονίδια ORF1a/b και N ανιχνεύθηκαν χρησιμοποιώντας το κιτ διάγνωσης νουκλεϊκών οξέων Sansure Biotech nCoV-2019 (ανίχνευση φθορισμού PCR).Προετοιμάστε ειδικούς ανιχνευτές για κάθε γονίδιο στόχο επιλέγοντας το κανάλι FAM για την περιοχή ORF1a/b και το κανάλι ROX για το γονίδιο Ν.Σε αυτό το κιτ δοκιμασίας, προστίθενται αντιδραστήρια έκλουσης και κύριου μίγματος ως εξής: προετοιμάστε 30 μl αντιδραστηρίου κύριου μίγματος και 20 μl εκλουόμενου δείγματος για ανίχνευση/ενίσχυση.Για ενίσχυση/ανίχνευση χρησιμοποιήθηκε PCR σε πραγματικό χρόνο ABI 750025.
Το τεστ SARS-CoV-2 BGI είναι ένα κιτ φθορισμού rRT-PCR σε πραγματικό χρόνο για τη διάγνωση του COVID-19.Η περιοχή στόχος βρίσκεται στην περιοχή ORF1a/b του γονιδιώματος SARS-CoV-2, η οποία είναι μια μέθοδος ανίχνευσης ενός γονιδίου.Επιπλέον, το γονίδιο της ανθρώπινης νοικοκυροσύνης β-ακτίνη είναι ένα εσωτερικά ρυθμιζόμενο γονίδιο στόχος.Το κύριο μείγμα παρασκευάζεται με ανάμειξη 20 μl του αντιδραστηρίου κύριου μίγματος και 10 μl του εκχυλισμένου δείγματος RNA σε μια πλάκα φρεατίου26.Για ενίσχυση και ανίχνευση χρησιμοποιήθηκε ένα όργανο φθορισμού ποσοτικής PCR σε πραγματικό χρόνο ABI 7500.Όλη η ενίσχυση νουκλεϊκού οξέος, οι συνθήκες εκτέλεσης PCR για κάθε δοκιμασία και η ερμηνεία των αποτελεσμάτων πραγματοποιήθηκαν σύμφωνα με τις οδηγίες του αντίστοιχου κατασκευαστή (Πίνακας 3).
Σε αυτήν τη συγκριτική ανάλυση, δεν χρησιμοποιήσαμε την τυπική μέθοδο αναφοράς για τον προσδιορισμό ποσοστιαίων συμφωνιών (θετική, αρνητική και συνολική) και άλλες παραμέτρους σύγκρισης για τις τέσσερις αναλύσεις.Κάθε σύγκριση δοκιμής έγινε με CRS, σε αυτή τη μελέτη το CRS ορίστηκε από τον κανόνα "οποιοδήποτε θετικό" και το αποτέλεσμα προσδιορίστηκε, όχι από ένα μόνο τεστ, χρησιμοποιήσαμε τουλάχιστον δύο ταιριαστά αποτελέσματα δοκιμής.Επιπλέον, στην περίπτωση μετάδοσης του COVID-19, τα ψευδώς αρνητικά αποτελέσματα είναι πιο επικίνδυνα από τα ψευδώς θετικά αποτελέσματα.Επομένως, για να πούμε "θετικό" όσο το δυνατόν ακριβέστερα από ένα αποτέλεσμα CRS, τουλάχιστον δύο δοκιμές ανάλυσης πρέπει να είναι θετικές, πράγμα που σημαίνει ότι τουλάχιστον ένα θετικό αποτέλεσμα είναι πιθανό να προέρχεται από μια δοκιμασία EUA.Έτσι, από τέσσερα αποτελέσματα δοκιμών, δύο ή περισσότερα αποτελέσματα δοκιμών που δίνουν το ίδιο αποτέλεσμα θεωρούνται αληθινά θετικά ή αρνητικά18,27.
Τα δεδομένα συλλέχθηκαν χρησιμοποιώντας δομημένες φόρμες εξαγωγής δεδομένων, η εισαγωγή και η ανάλυση των δεδομένων πραγματοποιήθηκε με τη χρήση στατιστικού λογισμικού Excel και SPSS έκδοσης 23.0 για περιγραφικές στατιστικές.Η θετική, η αρνητική και η συνολική ποσοστιαία συμφωνία αναλύθηκαν και χρησιμοποιήθηκε βαθμολογία Κάπα για να προσδιοριστεί ο βαθμός συμφωνίας κάθε μεθόδου με το CRS.Οι τιμές Kappa ερμηνεύονται ως εξής: 0,01 έως 0,20 για ήπια συμφωνία, 0,21 έως 0,40 για γενική συμφωνία, 0,41-0,60 για μέτρια συμφωνία, 0,61-0,80 για μείζονα συμφωνία και 0,81-0,99 για πλήρη συμφωνία28.
Η ηθική έγκριση ελήφθη από το Πανεπιστήμιο της Αντίς Αμπέμπα και όλα τα πειραματικά πρωτόκολλα για αυτήν τη μελέτη εγκρίθηκαν από την Επιστημονική Επιτροπή Αναθεώρησης Δεοντολογίας του Ινστιτούτου Δημόσιας Υγείας της Αιθιοπίας.Ο αριθμός αναφοράς για την Άδεια Δεοντολογίας EPHI είναι EPHI/IRB-279-2020.Όλες οι μέθοδοι εφαρμόστηκαν σύμφωνα με τις συστάσεις και τις διατάξεις των Εθνικών Συνολικών Κατευθυντήριων Γραμμών της Αιθιοπίας για τη θεραπεία του COVID-19.Επιπλέον, ελήφθη γραπτή ενημερωμένη συγκατάθεση από όλους τους συμμετέχοντες στη μελέτη πριν από τη συμμετοχή στη μελέτη.
Όλα τα δεδομένα που ελήφθησαν ή αναλύθηκαν σε αυτήν τη μελέτη περιλαμβάνονται σε αυτό το δημοσιευμένο άρθρο.Τα δεδομένα που υποστηρίζουν τα αποτελέσματα αυτής της μελέτης είναι διαθέσιμα από τον εκάστοτε συγγραφέα κατόπιν εύλογου αιτήματος.
Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας.Συστάσεις για στρατηγικές εργαστηριακών δοκιμών για τον COVID-19: Ενδιάμεση καθοδήγηση, 21 Μαρτίου 2020 Αρ. WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020).
Μούλιου, Δ.Σ., Πανταζόπουλος, Ι. & Γουργουλιανής, ΚΙ έξυπνη διάγνωση COVID-19 στο Τμήμα Επειγόντων Περιστατικών: All-in στην πράξη. Μούλιου, Δ.Σ., Πανταζόπουλος, Ι. & Γουργουλιανής, ΚΙ έξυπνη διάγνωση COVID-19 στο Τμήμα Επειγόντων Περιστατικών: All-in στην πράξη.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. and Gurgulianis, KI Ευφυής διάγνωση του COVID-19 στο τμήμα επειγόντων περιστατικών: τα πάντα στην πράξη.Muliou DS, Pantazopoulos I. and Gurgulyanis KI Ευφυής διάγνωση του COVID-19 σε τμήματα επειγόντων περιστατικών: ενσωμάτωση από άκρο σε άκρο στην πράξη.Expert Reverend Respire.φάρμακο.3, 263–272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA assay. Mitchell, SL & St George, K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA assay.Mitchell, SL and St. George, K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA assay.Mitchell SL και St. George K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA assay.J. Clinical.Ιός.128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
Ο ΟΠΟΙΟΣ.Εργαστηριακή ανίχνευση της νόσου του κορωνοϊού 2019 (COVID-19) σε ύποπτη ανθρώπινη νόσο.https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (πρόσβαση στις 15 Αυγούστου 2020) (ΠΟΥ, 2020).
Udugama, Β. et αϊ.Διάγνωση COVID-19: Ασθένειες και Εργαλεία Εξέτασης.ACS Nano 14(4), 3822–3835 (2020).
Οι Syed S. et al.Ίδρυση Κολλεγίου Παθολόγων Ανατολικής, Κεντρικής και Νότιας Αφρικής – Περιφερειακή Παθολογική Σχολή Μέσης Ανατολής και Νότιας Αφρικής.Αφρική.J. Lab.φάρμακο.9(1), 1-8 (2020).
Αιθιοπικό Ινστιτούτο Δημόσιας Υγείας, Ομοσπονδιακό Υπουργείο Υγείας.Ενδιάμεση Εθνική Στρατηγική και Καθοδήγηση για την Εργαστηριακή Διάγνωση του COVID-19.https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (πρόσβαση στις 12 Αυγούστου 2020) (EPHI, 2020).
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Εσφαλμένα αρνητικά τεστ για προκλήσεις και επιπτώσεις μόλυνσης από SARS-CoV-2. Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Εσφαλμένα αρνητικά τεστ για προκλήσεις και επιπτώσεις μόλυνσης από SARS-CoV-2.Voloshin S., Patel N. και Kesselheim AS ψευδώς αρνητικά τεστ για λοιμώξεις SARS-CoV-2 και οι συνέπειές τους.Voloshin S., Patel N. και Kesselheim AS ψευδώς αρνητικά τεστ για πρόκληση και τον αντίκτυπο της λοίμωξης SARS-CoV-2.N. eng.J. Ιατρική.383(6), e38 (2020).
Μούλιου, ΔΣ & Γουργουλιανής, Κ.Ι. Ψευδοθετικά και ψευδώς αρνητικά κρούσματα COVID-19: Στρατηγικές πρόληψης και διαχείρισης του αναπνευστικού συστήματος, εμβολιασμός και περαιτέρω προοπτικές. Μούλιου, ΔΣ & Γουργουλιανής, Κ.Ι. Ψευδοθετικά και ψευδώς αρνητικά κρούσματα COVID-19: Στρατηγικές πρόληψης και διαχείρισης του αναπνευστικού συστήματος, εμβολιασμός και περαιτέρω προοπτικές. Μούλιου, DS & Γουργουλιανής, Κ.Ι. Μούλιου, Δ.Σ. & Γουργουλιανής, Κ.Ι. Ψευδώς θετικά και ψευδώς αρνητικά κρούσματα COVID-19: αναπνευστικές στρατηγικές πρόληψης και θεραπείας, εμβολιασμός και η πορεία προς τα εμπρός.Muliu, DS and Gurgulianis, KI Ψευδώς θετικά και ψευδώς αρνητικά κρούσματα COVID-19: στρατηγικές για την αναπνευστική πρόληψη και θεραπεία, εμβολιασμός και μελλοντική πορεία.Expert Reverend Respire.φάρμακο.15(8), 993–1002 (2021).
Μούλιου, Δ.Σ., Ιωάννης, Π. & Κωνσταντίνος, Γ. Διάγνωση COVID-19 στο τμήμα επειγόντων περιστατικών: Βλέποντας το δέντρο αλλά χάνοντας το δάσος. Μούλιου, Δ.Σ., Ιωάννης, Π. & Κωνσταντίνος, Γ. Διάγνωση COVID-19 στο τμήμα επειγόντων περιστατικών: Βλέποντας το δέντρο αλλά χάνοντας το δάσος.Μούλιου, Δ.Σ., Ιωάννης, Π. και Κωνσταντίνος, Γ. COVID-19 Διάγνωση στο Τμήμα Επειγόντων Περιστατικών: Δείτε το Δέντρο, Χάστε το Δάσος.Muliou DS, Ioannis P., and Konstantinos G. COVID-19 Diagnosis in Emergency Rooms: Not Enough Forest for the Trees.Εμφανίζομαι.φάρμακο.J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-Angeli, E. et al.Επικύρωση και επικύρωση της αναλυτικής και κλινικής απόδοσης της ανάλυσης Abbott RealTime SARS-CoV-2.J. Clinical.Ιός.129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Σύγκριση πέντε σετ εκκινητών από διαφορετική περιοχή γονιδιώματος του COVID-19 για ανίχνευση μόλυνσης από ιό με συμβατική RT-PCR. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Σύγκριση πέντε σετ εκκινητών από διαφορετικές περιοχές γονιδιώματος του COVID-19 για ανίχνευση μόλυνσης από ιό με συμβατική RT-PCR.Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. and Aflatunyan, B. Σύγκριση πέντε σετ εκκινητών από διαφορετικές περιοχές του γονιδιώματος COVID-19 για ανίχνευση ιογενούς μόλυνσης με συμβατική RT-PCR. Mollaei, HR, Afshar, ΑΑ, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, Μ. & Aflatoonian, Β. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Σύγκριση 5 διαφορετικών γενετικών περιοχών του COVID-19 για ανίχνευση ιογενούς μόλυνσης με συμβατική RT-PCR.Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. and Aflatunyan B. Σύγκριση πέντε σετ εκκινητών από διαφορετικές περιοχές του γονιδιώματος COVID-19 για ανίχνευση ιογενούς μόλυνσης με συμβατική RT-PCR.Ιράν.J. Microbiology.12(3), 185 (2020).
Goertzer, Ι. et αϊ.Προκαταρκτικά αποτελέσματα του εθνικού προγράμματος εξωτερικής αξιολόγησης ποιότητας για την ανίχνευση αλληλουχιών γονιδιώματος SARS-CoV-2.J. Clinical.Ιός.129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
Wang, Μ. et αϊ.Αναλυτική αξιολόγηση της αποτελεσματικότητας πέντε κιτ RT-PCR για τον κορονοϊό σοβαρού οξέος αναπνευστικού συνδρόμου 2. J. Clinical.εργαστήριο.πρωκτός.35(1), e23643 (2021).
Wang Β. et al.Αξιολόγηση επτά εμπορικά διαθέσιμων κιτ ανίχνευσης RNA SARS-CoV-2 στην Κίνα με βάση την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης σε πραγματικό χρόνο (PCR).κλινικός.Χημική ουσία.εργαστήριο.φάρμακο.58(9), e149–e153 (2020).
van Casteren, PB et al.Σύγκριση επτά εμπορικών κιτ διάγνωσης RT-PCR COVID-19.J. Clinical.Ιός.128, 104412 (2020).
Lu, Yu, et αϊ.Σύγκριση διαγνωστικής απόδοσης δύο κιτ PCR για την ανίχνευση νουκλεϊκών οξέων SARS-CoV-2.J. Clinical.εργαστήριο.πρωκτός.34(10), e23554 (2020).
Lefart, PR, κ.λπ. Μια συγκριτική μελέτη τεσσάρων πλατφορμών δοκιμής ενίσχυσης νουκλεϊκού οξέος SARS-CoV-2 (NAAT) έδειξε ότι η απόδοση του ID NOW υποβαθμίστηκε σημαντικά ανάλογα με τον ασθενή και τον τύπο του δείγματος.διάγνωση.μικροβιολογία.Μολύνω.diss.99(1), 115200 (2021).
μόριο Abbott.Ένθετο πακέτου ανάλυσης SARS-CoV-2 της Abbott σε πραγματικό χρόνο.https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay.1-12.(Από τις 10 Αυγούστου 2020) (2020).
Klein, S. et αϊ.Απομόνωση RNA SARS-CoV-2 με χρήση μαγνητικών σφαιριδίων για ταχεία ανίχνευση μεγάλης κλίμακας με RT-qPCR και RT-LAMP.Virus 12(8), 863 (2020).